蛋白質(zhì)學(xué)組翻譯后修飾分析自中而下分析策略：自中而下的蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù)可用于組蛋白修飾的分析。樣品制備與普遍使用的自下而上的分析策略相同，直到得到純化的組蛋白。提取組蛋白后，用GluC進(jìn)行消化。然后用弱陽離子交換/親水相互作用色譜（WCX-HILIC）與配備電子轉(zhuǎn)移解離（ETD）的高分辨率質(zhì)譜聯(lián)機(jī)聯(lián)用，對樣品進(jìn)行理想的分離。譜識別可以用傳統(tǒng)的軟件進(jìn)行，但是由于估計(jì)適當(dāng)?shù)腻e誤發(fā)現(xiàn)率的問題，需要對結(jié)果進(jìn)行過濾。自上而下的技術(shù)可以直接引入完整的蛋白質(zhì)并在串聯(lián)質(zhì)譜儀上對其進(jìn)行片段化，不需要蛋白質(zhì)水解消化。目前，有兩種完全分離蛋白質(zhì)的方法：離線和在線。前者用四維分離法，后者用WCX-HILIC。蛋白質(zhì)翻譯后修飾在蛋白質(zhì)中磷酸化位點(diǎn)分析時應(yīng)該注意些什么問題？湖北磷酸化修飾蛋白質(zhì)組學(xué)分析研究

蛋白質(zhì)翻譯后修飾的檢測方法：質(zhì)譜是蛋白質(zhì)翻譯后修飾檢測的常用技術(shù)之一，可以用于已知和未知的翻譯后修飾檢測。蛋白質(zhì)翻譯后修飾（post-translational modifications，PTMs），如磷酸化、乙?；⒎核鼗?、SUMO化、糖基化等，大幅度的增加了蛋白質(zhì)組的復(fù)雜性。檢測蛋白質(zhì)的翻譯后修飾，了解它們?nèi)绾喂ぷ?、影響蛋白質(zhì)組和調(diào)控基因組將極大地提高我們對遺傳學(xué)和表觀遺傳學(xué)的理解。目標(biāo)蛋白的PTMs研究通常需要一個富集步驟，因?yàn)樾揎椀鞍椎呢S度一般較低。大多數(shù)PTMs檢測方法都是結(jié)合富集策略開發(fā)的，以比較好的識別、驗(yàn)證和研究目標(biāo)蛋白中PTMs的功能。廣東丙二酰化修飾蛋白質(zhì)組學(xué)研究自中而下的蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù)可用于組蛋白修飾的分析。

什么是蛋白質(zhì)的翻譯后修飾？蛋白質(zhì)的翻譯后修飾（）是指蛋白質(zhì)在翻譯后的化學(xué)修飾。對于大部分的蛋白質(zhì)來說，這是蛋白質(zhì)生物合成的較后步驟。PTM是細(xì)胞信號傳導(dǎo)中的重要組成部分。通過向修飾基團(tuán)添加一個或多個氨基酸殘基或通過蛋白質(zhì)水解切割該基團(tuán)來改變蛋白質(zhì)的性質(zhì)，是蛋白質(zhì)生物學(xué)功能表達(dá)的重要步驟。生物蛋白質(zhì)的翻譯后修飾極大地增加了蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)的類型和功能。這個過程調(diào)節(jié)細(xì)胞周期和蛋白質(zhì)轉(zhuǎn)錄，并影響表觀遺傳學(xué)。

蛋白質(zhì)磷酸化修飾定義？在哺乳動物細(xì)胞生命周期中，大約有1/3的蛋白質(zhì)發(fā)生過磷酸化修飾，在脊椎動物基因中，約有5%的基因編碼的蛋白質(zhì)是參與磷酸化和去磷酸化過程的蛋白激酶和磷酸酶。它可以通過激發(fā)、調(diào)節(jié)諸多信號通路進(jìn)而參與調(diào)控生物體的生長、發(fā)育、逆境應(yīng)激、疾病發(fā)生等多種生命過程，一直是生物學(xué)研究的重點(diǎn)與熱點(diǎn)。蛋白磷酸化是指在激酶催化作用下把ATP或者GTP的磷酸基團(tuán)（P04）轉(zhuǎn)移到不同種類的氨基酸上（主要包括絲氨酸S、蘇氨酸T、酪氨酸Y），從而使蛋白質(zhì)發(fā)生翻譯后修飾的過程。蛋白質(zhì)翻譯后修飾的作用主要是改變蛋白質(zhì)的活性。

蛋白質(zhì)乙酰化修飾的功能：目前對乙?；揎椀墓δ苎芯恐饕性趯?xì)胞轉(zhuǎn)錄調(diào)控，以及對代謝通路的調(diào)控這兩個方面。在眾多乙?；揎椀牡鞍踪|(zhì)中，研究較多的要數(shù)細(xì)胞核中包圍DNA的組蛋白了。組蛋白和DNA纏繞構(gòu)成核小體，組蛋白的甲基化、乙?；揎椖軌蛘{(diào)節(jié)DNA纏繞的松緊度，從而對基因表達(dá)進(jìn)行調(diào)控，因此，組蛋白的翻譯后修飾是表觀遺傳學(xué)研究中的重要一環(huán)。另外，研究也發(fā)現(xiàn)乙?；揎椘毡榇嬖谟谌说亩喾N代謝酶之中，并且參與調(diào)控代謝通路以及代謝酶的活性。其中在肝臟這樣的代謝中就存在著多種代謝酶被高度乙?；?。泛素化修飾是一種重要的翻譯后修飾。廣州蛋白質(zhì)翻譯后修飾組學(xué)分析

蛋白質(zhì)翻譯后修飾組學(xué)磷酸化修飾具有靈活的特性。湖北磷酸化修飾蛋白質(zhì)組學(xué)分析研究

蛋白質(zhì)乙?；揎楄b定流程：1. 組織/細(xì)胞破碎，提取、提純目的蛋白質(zhì)。2. 使用胰蛋白酶將目的蛋白酶解成多肽片段。3. 使用高效特異性乙?；贵w對乙酰化修飾肽段進(jìn)行免疫富集。4. 使用LC-MS/MS對富集的乙?；亩芜M(jìn)行鑒定分析。5. 數(shù)據(jù)分析，并對鑒定的乙?；稽c(diǎn)的生物學(xué)功能進(jìn)行解釋預(yù)測。隨著蛋白質(zhì)組研究的發(fā)展，我們越來越深刻地意識到，對于生物體生命活動的管理和調(diào)控過程，密切相關(guān)的不只是單個蛋白質(zhì)層面的修飾狀態(tài)，更重要的是研究蛋白質(zhì)組學(xué)水平研究在翻譯后修飾的動態(tài)變化。高質(zhì)、高效的蛋白質(zhì)翻譯后修飾富集技術(shù)和豐富的、準(zhǔn)確的定量手段使得研究蛋白質(zhì)水平的翻譯后修飾組學(xué)成為現(xiàn)實(shí)，借助這些組學(xué)研究手段能夠?qū)崿F(xiàn)不同生理病理狀態(tài)下生物樣本在翻譯后修飾水平上的定量比較，深入地揭示翻譯后修飾水平的波動與生物生命活動的密切聯(lián)系。湖北磷酸化修飾蛋白質(zhì)組學(xué)分析研究

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