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哈爾濱常規(guī)靶向代謝組學(xué)方法

來源: 發(fā)布時間:2022-03-17

代謝組學(xué)發(fā)展前景:較低的費用,是促使代謝組學(xué)在臨床上易于接受的另一個原因。與其他“組學(xué)”研究相比,代謝組學(xué)的費用更低,研究人員可以通過代謝組學(xué)研究篩檢出代謝產(chǎn)物,然后采用更昂貴的基因組學(xué)和蛋白質(zhì)組學(xué)的方法對有意義的代謝產(chǎn)物進(jìn)一步加以研究。首先,必須識別出代謝產(chǎn)物,這并不是簡單的工作。代謝組學(xué)研究比較大的挑戰(zhàn)就在于對代謝產(chǎn)物的識別,這也是比較有趣的方面,而更具挑戰(zhàn)性的工作,是進(jìn)一步確認(rèn)所有代謝物的功能。此外,質(zhì)譜分析發(fā)現(xiàn),代謝產(chǎn)物的同質(zhì)性不高,由于缺乏均勻性,使色譜分析變得更加困難,無法識別出樣品中的未知物質(zhì)。代謝組學(xué)的研究處于生物信息流的中游。哈爾濱常規(guī)靶向代謝組學(xué)方法

代謝組學(xué)需要多少的生物學(xué)重復(fù)?生物學(xué)重復(fù)指的是相同處理的相同類型的生物樣本的數(shù)量(如相同劑量給藥后2小時的小鼠采集并且相同儲存條件和處理方法血清樣本)。相較于基因和蛋白,代謝物處于生命活動的下游,收到環(huán)境和遺傳背景等因素影響較大,生物學(xué)重復(fù)少可能會放大組內(nèi)差異對于整體差異的影響,進(jìn)而影響結(jié)果(如準(zhǔn)確和足夠多的找出生物標(biāo)志物)。因此根據(jù)不同的生物類型,需要不同的生物學(xué)重復(fù)來增加數(shù)據(jù)的可靠性和說服力。代謝組學(xué)的研究方法與蛋白質(zhì)組學(xué)的方法類似。上海動物靶向代謝組學(xué)研究方法代謝組學(xué)在生物信息的傳遞中起到承上啟下的作用。

GC-MS非靶向與代謝組學(xué)的關(guān)系?代謝組學(xué)是運用多種技術(shù)手段,研究生物體系中小分子代謝物(包括氨基酸、糖和磷酸糖、生物胺和脂質(zhì)等)的種類、數(shù)量及變化規(guī)律的科學(xué),是系統(tǒng)生物學(xué)的重要組成部分。其中GC-MS非靶向代謝組學(xué)是對生物體內(nèi)源性代謝物進(jìn)行系統(tǒng)全方面的分析平臺。氣相色譜-質(zhì)譜聯(lián)用(GC-MS)技術(shù)因為其較為成熟、分辨率高、靈敏度高、重現(xiàn)性好,擁有大量標(biāo)準(zhǔn)質(zhì)譜圖數(shù)據(jù)庫的特點,被大量地運用在植物、動物、微生物的研究中。隨著信息科學(xué)和分析技術(shù)的發(fā)展,運用GC-MS非靶向代謝組學(xué)研究疾病機制和發(fā)現(xiàn)藥物靶點的方法日趨成熟,其重要性也日益凸顯。GC-MS非靶向代謝組學(xué)也在代謝性疾病等藥物靶點、疾病機制研究和藥物靶點發(fā)現(xiàn)中提供重要參考和啟示。

GC-MS非靶向代謝組學(xué)能檢測到哪些類別的代謝物?衍生化極大地拓展了GC/MS的檢測分析范圍。GC/MS能檢測到有機酸、氨基酸、單糖、糖醇、胺類、脂肪酸、吲哚、單甘油酯、核苷、二糖、生育酚、甾醇和膽汁酸等代謝物。如何提高定性準(zhǔn)確度?GC/MS的定性有雙重標(biāo)準(zhǔn),一是保留指數(shù),二是質(zhì)譜信息的相似度(similarity)。不同于LC/MS的軟電離源,GC/MS使用的EI源屬于硬電離,能量較強且穩(wěn)定,在將代謝物分子電離后,分子離子峰進(jìn)一步碎裂產(chǎn)生豐富的碎片離子。因此,我們很難在GC/MS上看到分子離子峰。GC/MS提供的是代謝物的“指紋圖譜”,將儀器得到的實際指紋圖譜和質(zhì)譜庫(如NIST庫)進(jìn)行比對后,我們將會得到一個叫相似度的指標(biāo)。保留指數(shù)和相似度都必須滿足設(shè)定的閾值,軟件才會給出色譜峰的定性結(jié)果。然后采用標(biāo)準(zhǔn)品質(zhì)譜信息進(jìn)行完全比對定性,也就是說只有經(jīng)過標(biāo)準(zhǔn)品比對,代謝物才是被100%定性。非靶向代謝組學(xué)(Untargeted metabolomics)即非目標(biāo)代謝組學(xué)或發(fā)現(xiàn)代謝組學(xué)。

什么是非靶向代謝組學(xué)、靶向代謝組學(xué)?(1) 非靶向代謝組學(xué)(Untargeted metabolomics)即非目標(biāo)代謝組學(xué)或發(fā)現(xiàn)代謝組學(xué),無偏向性地對所有小分子代謝物(一般相對分子量小于1000)同時進(jìn)行檢測分析的代謝組學(xué)。(2) 靶向代謝組學(xué)(Trgeted metabolomics)則為目標(biāo)性代謝組學(xué),著重對于設(shè)定好的目標(biāo)代謝物進(jìn)行定性、量檢測分析和研究。相比于其他組學(xué),代謝組學(xué)有哪些特殊的優(yōu)勢?系統(tǒng)生物學(xué)有基因組學(xué)、轉(zhuǎn)錄組學(xué)、蛋白組學(xué)和代謝組學(xué)。代謝組學(xué)作為系統(tǒng)生物學(xué)的一個重要的分支,與其他組學(xué)相比有著其特有的優(yōu)勢,主要體現(xiàn)在以下幾點:(1) 基因與蛋白質(zhì)表達(dá)的微小變化會在相應(yīng)代謝物水平上得到放大,更容易被檢測。(2) 代謝物的種類要遠(yuǎn)小于基因和蛋白的數(shù)目。(3) 可與生物表型變化建立直接相關(guān)性。代謝組學(xué)是用來解決什么問題的?浙江個性化定制靶向代謝組學(xué)檢測價格

代謝組學(xué)技術(shù)可應(yīng)用于功能基因組學(xué)。哈爾濱常規(guī)靶向代謝組學(xué)方法

代謝組學(xué)樣品收集方法及所需樣本量是什么?根據(jù)不同的檢測要求,需要配合不同的樣本量和樣本采集方法,常規(guī)的方法和單個樣本量如下:(1) 微生物和細(xì)胞樣本:細(xì)胞迅速猝滅細(xì)胞并冷凍保存;單個樣本細(xì)胞數(shù)量要求10^6。(2) 動物體液(如尿、血、組織、唾液):采樣后要迅速預(yù)處理,如加入抗凝血劑、防腐劑,并立即冷凍處理(-80 ℃);單個樣本要求體積為10μL。(3) 植物樣本:采集后迅速冷凍(液氮),然后轉(zhuǎn)入-80℃保存,單個樣本要求質(zhì)量為50mg。哈爾濱常規(guī)靶向代謝組學(xué)方法

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