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武漢蛋白質(zhì)亞硝基化修飾組學(xué)技術(shù)服務(wù)

來源: 發(fā)布時間:2022-03-31

翻譯后修飾蛋白組學(xué)分析:蛋白質(zhì)組學(xué)的研究的工作不只聚焦于細(xì)胞不同生長時期或是疾病條件下的蛋白質(zhì)表達(dá)水平變化,許多至關(guān)重要的生命進程不只由蛋白質(zhì)相對豐度控制,更重要的是被時空特異分布的、可逆的翻譯后修飾所調(diào)控,因而揭示翻譯后修飾發(fā)生規(guī)律是解析蛋白質(zhì)復(fù)雜多樣的生物功能的一個重要前提。蛋白質(zhì)發(fā)生翻譯后修飾時其分子質(zhì)量會發(fā)生響應(yīng)的改變,通過質(zhì)譜能夠精確測定蛋白質(zhì)或多肽的分子質(zhì)量。同時,發(fā)生翻譯后修飾的蛋白質(zhì)再樣本中含量低且動態(tài)范圍廣,所以在質(zhì)譜檢測前需要對發(fā)生修飾的蛋白質(zhì)或肽段進行富集。常見的蛋白質(zhì)翻譯后修飾包括糖基化。武漢蛋白質(zhì)亞硝基化修飾組學(xué)技術(shù)服務(wù)

蛋白質(zhì)學(xué)組翻譯后修飾分析自中而下分析策略:自中而下的蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù)可用于組蛋白修飾的分析。樣品制備與普遍使用的自下而上的分析策略相同,直到得到純化的組蛋白。提取組蛋白后,用GluC進行消化。然后用弱陽離子交換/親水相互作用色譜(WCX-HILIC)與配備電子轉(zhuǎn)移解離(ETD)的高分辨率質(zhì)譜聯(lián)機聯(lián)用,對樣品進行理想的分離。譜識別可以用傳統(tǒng)的軟件進行,但是由于估計適當(dāng)?shù)腻e誤發(fā)現(xiàn)率的問題,需要對結(jié)果進行過濾。自上而下的技術(shù)可以直接引入完整的蛋白質(zhì)并在串聯(lián)質(zhì)譜儀上對其進行片段化,不需要蛋白質(zhì)水解消化。目前,有兩種完全分離蛋白質(zhì)的方法:離線和在線。前者用四維分離法,后者用WCX-HILIC。蛋白質(zhì)棕櫚?;揎椊M學(xué)費用蛋白質(zhì)翻譯后修飾組學(xué)磷酸化修飾具有可逆的特性。

蛋白質(zhì)翻譯后修飾組學(xué):蛋白質(zhì)翻譯后修飾(Post-translational modification, PTM)是指對翻譯后的蛋白質(zhì)進行共價加工的過程。它通過在一個或多個氨基酸殘基加上修飾基團,可以改變蛋白質(zhì)的物理、化學(xué)性質(zhì),進而影響蛋白質(zhì)的空間構(gòu)象和活性狀態(tài)、亞細(xì)胞定位、折疊及其穩(wěn)定性以及蛋白質(zhì)-蛋白質(zhì)相互作用。蛋白質(zhì)翻譯后修飾的豐度變化在生命活動研究中具有重大意義,異常的翻譯后修飾會導(dǎo)致多種疾病的發(fā)生。質(zhì)譜可以分辨蛋白質(zhì)修飾前和修飾后分子量上的變化,因此只要知道靶蛋白翻譯后修飾前后分子量的變化,就能對翻譯后修飾方式進行鑒定和定量。

質(zhì)譜分析乙?;鞍踪|(zhì)組:質(zhì)譜分析技術(shù)可以對蛋白質(zhì)組中的乙?;鞍走M行鑒定、乙?;稽c定位以及定量。當(dāng)質(zhì)譜用于乙酰化定量蛋白組研究中時,因為乙?;鞍踪|(zhì)在生物樣本中含量低、動態(tài)范圍廣,需要先對乙酰化肽段進行富集,然后再對富集得到的乙?;亩螛悠愤M行定量分析。質(zhì)譜定量乙酰化蛋白組采用肽段預(yù)分離降低高豐度蛋白的影響,結(jié)合免疫共沉淀通過高效的抗體富集乙酰化的肽段,從而實現(xiàn)大規(guī)模乙酰化的鑒定及定量。為了鑒定和定量更多的乙酰化肽段,在酶切過程中還可使用多種不同的酶對蛋白樣品進行酶切。蛋白質(zhì)乙?;揎椊M學(xué)技術(shù)對細(xì)胞核內(nèi)轉(zhuǎn)錄調(diào)控因子的刺激有著重要的作用。

蛋白質(zhì)乙?;揎楄b定流程:1. 組織/細(xì)胞破碎,提取、提純目的蛋白質(zhì)。2. 使用胰蛋白酶將目的蛋白酶解成多肽片段。3. 使用高效特異性乙?;贵w對乙?;揎楇亩芜M行免疫富集。4. 使用LC-MS/MS對富集的乙?;亩芜M行鑒定分析。5. 數(shù)據(jù)分析,并對鑒定的乙酰化位點的生物學(xué)功能進行解釋預(yù)測。隨著蛋白質(zhì)組研究的發(fā)展,我們越來越深刻地意識到,對于生物體生命活動的管理和調(diào)控過程,密切相關(guān)的不只是單個蛋白質(zhì)層面的修飾狀態(tài),更重要的是研究蛋白質(zhì)組學(xué)水平研究在翻譯后修飾的動態(tài)變化。高質(zhì)、高效的蛋白質(zhì)翻譯后修飾富集技術(shù)和豐富的、準(zhǔn)確的定量手段使得研究蛋白質(zhì)水平的翻譯后修飾組學(xué)成為現(xiàn)實,借助這些組學(xué)研究手段能夠?qū)崿F(xiàn)不同生理病理狀態(tài)下生物樣本在翻譯后修飾水平上的定量比較,深入地揭示翻譯后修飾水平的波動與生物生命活動的密切聯(lián)系。蛋白質(zhì)磷酸化修飾鑒定方法有免疫印跡技術(shù)。蛋白質(zhì)棕櫚?;揎椊M學(xué)費用

蛋白質(zhì)翻譯后修飾組學(xué)磷酸化修飾具有靈活的特性。武漢蛋白質(zhì)亞硝基化修飾組學(xué)技術(shù)服務(wù)

蛋白質(zhì)翻譯后修飾組學(xué):血漿蛋白糖基化修飾分析:蛋白質(zhì)糖基化指碳水化合物通過共翻譯或翻譯后修飾的方式附著到蛋白質(zhì)上的過程,是一種常見的蛋白質(zhì)翻譯后修飾。分泌的細(xì)胞外蛋白常被糖基化,糖基化蛋白通常是重要的整合膜蛋白。血漿中的蛋白質(zhì)包括維持機體正常生理狀態(tài)的蛋白質(zhì)和機體分泌、滲漏、脫落的蛋白質(zhì),其中不乏存在一些糖基化蛋白質(zhì)。而蛋白質(zhì)糖基化修飾不只影響蛋白質(zhì)的空間構(gòu)象、生物活性、運輸和定位,而且在分子識別、細(xì)胞通信、信號轉(zhuǎn)導(dǎo)等特定生物過程中發(fā)揮著至關(guān)重要的作用。因此對血漿蛋白糖基化進行分析,有助于研究血漿蛋白的生理功能等。武漢蛋白質(zhì)亞硝基化修飾組學(xué)技術(shù)服務(wù)

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