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上海丙?;揎椀鞍踪|組學研究

來源: 發(fā)布時間:2022-04-02

蛋白質學組翻譯后修飾分析自中而下分析策略:自中而下的蛋白質組學技術可用于組蛋白修飾的分析。樣品制備與普遍使用的自下而上的分析策略相同,直到得到純化的組蛋白。提取組蛋白后,用GluC進行消化。然后用弱陽離子交換/親水相互作用色譜(WCX-HILIC)與配備電子轉移解離(ETD)的高分辨率質譜聯(lián)機聯(lián)用,對樣品進行理想的分離。譜識別可以用傳統(tǒng)的軟件進行,但是由于估計適當?shù)腻e誤發(fā)現(xiàn)率的問題,需要對結果進行過濾。自上而下的技術可以直接引入完整的蛋白質并在串聯(lián)質譜儀上對其進行片段化,不需要蛋白質水解消化。目前,有兩種完全分離蛋白質的方法:離線和在線。前者用四維分離法,后者用WCX-HILIC。蛋白質翻譯后修飾的作用主要是改變蛋白質的功能。上海丙?;揎椀鞍踪|組學研究

蛋白質磷酸化修飾定義?在哺乳動物細胞生命周期中,大約有1/3的蛋白質發(fā)生過磷酸化修飾,在脊椎動物基因中,約有5%的基因編碼的蛋白質是參與磷酸化和去磷酸化過程的蛋白激酶和磷酸酶。它可以通過激發(fā)、調節(jié)諸多信號通路進而參與調控生物體的生長、發(fā)育、逆境應激、疾病發(fā)生等多種生命過程,一直是生物學研究的重點與熱點。蛋白磷酸化是指在激酶催化作用下把ATP或者GTP的磷酸基團(P04)轉移到不同種類的氨基酸上(主要包括絲氨酸S、蘇氨酸T、酪氨酸Y),從而使蛋白質發(fā)生翻譯后修飾的過程。山東蛋白質丙?;揎椊M學主要方式蛋白質翻譯后修飾的作用主要是改變蛋白質的活性。

蛋白質乙?;揎椀墓δ埽耗壳皩σ阴;揎椀墓δ苎芯恐饕性趯毎D錄調控,以及對代謝通路的調控這兩個方面。在眾多乙?;揎椀牡鞍踪|中,研究較多的要數(shù)細胞核中包圍DNA的組蛋白了。組蛋白和DNA纏繞構成核小體,組蛋白的甲基化、乙?;揎椖軌蛘{節(jié)DNA纏繞的松緊度,從而對基因表達進行調控,因此,組蛋白的翻譯后修飾是表觀遺傳學研究中的重要一環(huán)。另外,研究也發(fā)現(xiàn)乙?;揎椘毡榇嬖谟谌说亩喾N代謝酶之中,并且參與調控代謝通路以及代謝酶的活性。其中在肝臟這樣的代謝中就存在著多種代謝酶被高度乙酰化。

蛋白質學組翻譯后修飾的研究策略:目前,有幾種分析蛋白質翻譯后修飾的策略,包括質譜(MS)、Eastern blotting、放射性標記和Western blotting。放射性標記和Western blotting是比較傳統(tǒng)、特異性和相對定量的方法。該過程需要事先知道翻譯后修飾類型。局限性包括抗體的特異性和可用性。質譜技術也常被用于翻譯后修飾分析,不受修飾類型和相關修飾位點的現(xiàn)有知識的限制。自下而上:自下而上的技術是蛋白質組學研究中使用的質譜策略之一。在根據(jù)序列鑒定肽之前,需要使用蛋白酶消化蛋白質。由于該技術不能保證在檢測過程中被檢測肽的完整性和穩(wěn)定性,因此無法獲得不同蛋白質翻譯后修飾之間關系的信息,這意味著它無法檢測到某些修飾。因此,該方法不適用于分析組蛋白的組合翻譯后修飾。蛋白質糖基化指碳水化合物通過共翻譯或翻譯后修飾的方式附著到蛋白質上的過程。

蛋白翻譯后修飾:蛋白質氨基酸序列的特定位置可以與化學基團或者小分子量的蛋白共價結合從而發(fā)生蛋白質翻譯后修飾(post-translational modifications,PTMs)。翻譯后修飾是蛋白質生物合成的一個步驟,翻譯后多肽鏈在成為成熟的蛋白質產(chǎn)品之前要經(jīng)過修飾,PTMs的類型包括磷酸化、乙?;?、糖基化、泛素化和二硫鍵等等,它導致蛋白質組復雜性的大幅增加。對于任何給定的蛋白質,各種各樣的PTMs提供了一種通過改變蛋白質的結構和功能來促進細胞快速變化的方法。PTMs在信號轉導、蛋白質穩(wěn)定性和周轉率、蛋白質與蛋白質識別和相互作用以及空間定位中起著至關重要的作用。常見的蛋白質翻譯后修飾包括乙?;?。浙江丙?;揎椀鞍踪|組學質譜分析

蛋白質磷酸化修飾怎么定義?上海丙?;揎椀鞍踪|組學研究

蛋白質翻譯后修飾有什么生物學意義?可以使蛋白質具有生物活性,可以發(fā)揮相應的功能。翻譯是蛋白質生物合成(基因表達中的一部分,基因表達還包括轉錄)過程中的第二步(轉錄為第1步),翻譯是根據(jù)遺傳密碼的中心法則,將成熟的信使RNA分子(由DNA通過轉錄而生成)中“堿基的排列順序”(核苷酸序列)解碼,并生成對應的特定氨基酸序列的過程。但也有許多轉錄生成的RNA,如轉運RNA(tRNA)、核糖體RNA(rRNA)和小核RNA(snRNA)等并不被翻譯為氨基酸序列。上海丙?;揎椀鞍踪|組學研究

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