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廣州circ RNA轉(zhuǎn)錄組學(xué)服務(wù)

來源: 發(fā)布時間:2022-04-18

轉(zhuǎn)錄組學(xué):轉(zhuǎn)錄組學(xué)是研究特定的細胞、組織或個體在特定時間和狀態(tài)下所轉(zhuǎn)錄出所有RNA的學(xué)科,轉(zhuǎn)錄組測序是指利用高通量測序方法,研究特定的細胞、組織或個體在特定時間和狀態(tài)下所轉(zhuǎn)錄出的所有mRNA,用于揭示不同功能狀態(tài)下的基因表達、結(jié)構(gòu)的差異,闡明分子機制。應(yīng)用領(lǐng)域:醫(yī)學(xué)研究:疾病標(biāo)志物篩查、疾病的診斷和分型、疾病復(fù)發(fā)診斷、病因與病理機制探究、臨床療效評價、藥物毒理學(xué)評價。生命科學(xué)研究:非生物環(huán)境關(guān)系研究、植物與微生物、在表型鑒定中的應(yīng)用、代謝途徑及功能基因組研究、藥用植物研究中的應(yīng)用。轉(zhuǎn)錄組學(xué)包括:mRNA、ncRNA、rRNA等。廣州circ RNA轉(zhuǎn)錄組學(xué)服務(wù)

全長轉(zhuǎn)錄組測序的優(yōu)勢:1、全方面鑒定可變剪切;2、發(fā)現(xiàn)更多新基因;3、有效改善基因組注釋;4、鑒定更多的LncRNA;5、準(zhǔn)確定位融合基因。研究思路:由于全長轉(zhuǎn)錄組測序是基于第三代測序技術(shù),因而其成本依然較高,如果全部研究項目均基于全長轉(zhuǎn)錄組,通常來說很難承擔(dān),因此,全長轉(zhuǎn)錄組測序一般與普通轉(zhuǎn)錄組測序相結(jié)合。宏轉(zhuǎn)錄組學(xué)是什么?宏轉(zhuǎn)錄組學(xué)也稱為環(huán)境轉(zhuǎn)錄組學(xué),指從整體水平上研究某一特定環(huán)境、特定時期菌群群體全部基因轉(zhuǎn)錄情況以及轉(zhuǎn)錄調(diào)控規(guī)律,以揭示微生物在不同環(huán)境壓力下的適應(yīng)機制,探索環(huán)境與微生物之間的相互作用機理。武漢宏轉(zhuǎn)錄學(xué)組分析研究circRNA主要存在于細胞質(zhì)或外泌體中,具有組織特異性、疾病特異性、時序特異性及高穩(wěn)定性等特征。

轉(zhuǎn)錄組是特定發(fā)育階段或生理條件下細胞內(nèi)的完整轉(zhuǎn)錄信息的匯合,表示了基因表達的中間狀態(tài)。轉(zhuǎn)錄組測序可以對所有轉(zhuǎn)錄物進行分類、確定基因的轉(zhuǎn)錄結(jié)構(gòu)、量化轉(zhuǎn)錄物的表達水平。蛋白質(zhì)是生命功能的直接執(zhí)行者,蛋白組是一種細胞乃至一種生物所表達的全部蛋白質(zhì)。整合轉(zhuǎn)錄組學(xué)和蛋白質(zhì)組學(xué)的表達數(shù)據(jù)對生物樣本進行研究,可以從整體上解釋生物學(xué)問題,探究生物體生理和疾病機理等。轉(zhuǎn)錄組學(xué)應(yīng)用于胃腸瘤發(fā)生機制研究:利用轉(zhuǎn)錄組學(xué)可檢測瘤細胞惡化過程中的RNA(編碼RNA及非編碼RNA)的變化,有助于更好地理解胃腸瘤的發(fā)生機制。

circRNA轉(zhuǎn)錄組學(xué)生物學(xué)功能:circRNA主要存在于細胞質(zhì)或外泌體中,具有組織特異性、疾病特異性、時序特異性及高穩(wěn)定性等特征。近幾年,大量的研究表明circRNA在生物的生長發(fā)育、脅迫應(yīng)答、疾病發(fā)生和發(fā)展等方面密切相關(guān),并預(yù)測其在疾病診斷標(biāo)記物等方面的應(yīng)用前景,但其生物學(xué)功能在很大程度上仍然未知。目前認可度比較高的circRNA生物學(xué)功能。circRNA轉(zhuǎn)錄組學(xué)成環(huán)機制:circRNA環(huán)化方式分為內(nèi)含子環(huán)化和外顯子環(huán)化。目前主流的成環(huán)機制可歸類為:依賴于剪切體的索尾插接環(huán)化。在mRNA前體上,通過連續(xù)的組裝小核核糖體蛋白從而催化外顯子下游的5′ 供體的位點連接到上游的3′ 受體的位點,索尾插接形成環(huán)化,然后通過剪切形成circRNA。順式作用元件促進circRNA形成。轉(zhuǎn)錄組是干什么用的,和表達譜有什么區(qū)別?

轉(zhuǎn)錄組學(xué):隨著越來越多的基因組序列相繼被測定,生命科學(xué)的研究進入了后基因組時代,各類組學(xué)技術(shù)得到迅速地發(fā)展與普遍地應(yīng)用包括以基因為研究對象的基因組學(xué)(Genomics)、以轉(zhuǎn)錄過程為研究對象的轉(zhuǎn)錄組學(xué)(Transcriptomics)。意義:1.轉(zhuǎn)錄組譜可以提供特定條件下某些基因表達的信息,并據(jù)此推斷相應(yīng)未知基因的功能,揭示特定調(diào)節(jié)基因的作用機制.2.通過基于基因表達譜的分子標(biāo)簽,不只可以辨別細胞的表型歸屬,還可以用于疾病的診斷.3.轉(zhuǎn)錄組的研究應(yīng)用于臨床的另一個例子是可以將表面上看似相同的病癥分為多個亞型,尤其是對原發(fā)性惡性瘤,通過轉(zhuǎn)錄組差異表達譜的建立,可以詳細描繪出患者的生存期以及對藥物的反應(yīng)等。轉(zhuǎn)錄組學(xué)可應(yīng)用于炎癥發(fā)生機制的發(fā)現(xiàn)及干預(yù)。廣州circ RNA轉(zhuǎn)錄組學(xué)服務(wù)

轉(zhuǎn)錄組學(xué)測序必須做生物學(xué)重復(fù)么?廣州circ RNA轉(zhuǎn)錄組學(xué)服務(wù)

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