代謝組學(xué)的研究分為靶向和非靶向。通俗說就是你有沒有目標(biāo)分子。傳統(tǒng)代謝組學(xué)研究利用的是GC-MS，因?yàn)榇x物大多數(shù)都不是高沸點(diǎn)的，而且GC-MS有龐大的數(shù)據(jù)庫檢索。然后發(fā)展的LC-MS差不多，就是克服了一些高沸點(diǎn)物質(zhì)難以檢測的弊端。NMR用于代謝組學(xué)不是很多，一方面是NMR這個(gè)東西入行起點(diǎn)有點(diǎn)高，另一方面是樣品太復(fù)雜而且靈敏度不高。但是NMR樣品處理簡單，無損。不需要各種衍生化。而且NMR對于物質(zhì)結(jié)構(gòu)的指認(rèn)要比MS更精確（比如異構(gòu)體）因此對定性非常有用，成為非靶向代謝組學(xué)的重要方法。代謝組學(xué)是效仿基因組學(xué)和蛋白質(zhì)組學(xué)的研究思想。四川常規(guī)靶向代謝組學(xué)應(yīng)用

代謝組學(xué)研究方法： 對于代謝產(chǎn)物來說，不只只有質(zhì)譜峰這個(gè)特征。更進(jìn)一步說，質(zhì)譜（MS）并不能檢測出所有的代謝產(chǎn)物，并不是因?yàn)橘|(zhì)譜的靈敏度不夠，而是由于質(zhì)譜只能檢測離子化的物質(zhì)，但有些代謝產(chǎn)物在質(zhì)譜儀中不能被離子化。采用核磁共振（NMR）的方法，可以彌補(bǔ)色譜的不足。過去，只有毒理學(xué)方面的研究使用核磁共振，而質(zhì)譜只在植物代謝研究中采用。如今，這兩種方法在代謝組學(xué)研究中已經(jīng)普遍使用。為在不同樣品間進(jìn)行有意義的比較，研究人員必須結(jié)合使用這兩種方法獲得的大量數(shù)據(jù)進(jìn)行分析。此外，還需要結(jié)合基因組學(xué)研究獲得的數(shù)據(jù)。濟(jì)南代謝組學(xué)研究代謝組學(xué)主要技術(shù)手段是色譜（HPLC，GC）。

選擇代謝組學(xué)作為科研技術(shù)手段的優(yōu)勢有哪些？代謝組學(xué)的研究處于生物信息流的中游，介于基因、蛋白質(zhì)和細(xì)胞、組織之間，在生物信息的傳遞中起到承上啟下的作用。小分子的產(chǎn)生和代謝是基因表達(dá)的下游產(chǎn)物，生物體液的代謝產(chǎn)物分析能夠更直接，更準(zhǔn)確的反映生物體的病理生理狀態(tài)。代謝物的種類少，大約在103個(gè)數(shù)量級，要遠(yuǎn)小于基因和蛋白質(zhì)的數(shù)據(jù)，物質(zhì)的分子結(jié)構(gòu)要簡單得多，分析起來更簡單明了。代謝組學(xué)的代謝物信息庫簡單，它遠(yuǎn)沒有全基因組測序及大量表達(dá)序列標(biāo)簽的數(shù)據(jù)庫那么復(fù)雜?；蚝偷鞍踪|(zhì)表達(dá)的有效微小變化會在代謝物上得到放大，從而使檢測更容易。代謝產(chǎn)物在各個(gè)生物體系中都是類似的，所以代謝組學(xué)研究中采用的技術(shù)更容易在各個(gè)領(lǐng)域中通用，也更容易被人接受。

代謝組學(xué)介紹：通過液質(zhì)聯(lián)用（LC-MS）方法檢測生物體受外界刺激前后體內(nèi)大多數(shù)小分子代謝物的動態(tài)變化，重點(diǎn)尋找在實(shí)驗(yàn)組和對照組中有明顯變化的代謝物，進(jìn)而研究這些代謝物與生理病理變化的相關(guān)關(guān)系，其研究對象大多是分子量1500Da以內(nèi)的小分子物質(zhì)。技術(shù)優(yōu)勢：較高的靈敏度、分辨率；較寬的動態(tài)范圍；適合對標(biāo)本中未知代謝物的探索研究；適合于生物樣本中復(fù)雜代謝產(chǎn)物的檢測和潛在標(biāo)志物的鑒定。代謝組學(xué)應(yīng)用方向： 土壤代謝組學(xué)。研究土壤中有機(jī)質(zhì)及土壤微生物代謝含量變化及相互作用，了解土壤微生物多樣性及其碳代謝能力，為探索調(diào)節(jié)、控制和改善土壤環(huán)境質(zhì)量提供重要的參考。代謝組學(xué)技術(shù)可應(yīng)用于病因病機(jī)研究。

什么是代謝組學(xué)？代謝組學(xué)是用來解決什么問題的？代謝組學(xué)（Metabonomics/Metabolomics）是發(fā)展起來的一門新興學(xué)科，是研究關(guān)于生物體被擾動后（如基因的改變或環(huán)境變化后）其代謝產(chǎn)物（內(nèi)源性代謝物質(zhì)）種類、數(shù)量及其變化規(guī)律的科學(xué)。代謝組學(xué)著重研究的是生物整體或組織的內(nèi)源性代謝物質(zhì)的代謝途徑及其所受內(nèi)在或者外在因素的影響及隨時(shí)間變化的規(guī)律。代謝組學(xué)通過揭示內(nèi)在和外在因素影響下代謝整體的變化軌跡來反映某種病理生理過程中所發(fā)生的一系列生物事件。代謝組學(xué)主要研究的是作為各種代謝路徑的底物和產(chǎn)物的小分子代謝物（MW<1000）。濟(jì)南代謝組學(xué)研究

靶向代謝組學(xué)（Trgeted metabolomics）則為目標(biāo)性代謝組學(xué)。四川常規(guī)靶向代謝組學(xué)應(yīng)用

靶向代謝組學(xué)的一般分析流程為：1. 數(shù)據(jù)采集 第1步是得到標(biāo)準(zhǔn)品。如果無法從市場上買到，就必須定制合成。然后通過優(yōu)化產(chǎn)物離子碰撞能量以得到的信號，再通過測定三重串聯(lián)四極桿測定代謝物的 MRM 躍遷值。2. 定量 接下來用定量分析軟件對 MRM 數(shù)據(jù)進(jìn)行處理，得到報(bào)告。3. 統(tǒng)計(jì)分析和解釋 將定量報(bào)告輸入統(tǒng)計(jì)分析軟件包，用統(tǒng)計(jì)工具，如ANOVA，對數(shù)據(jù)進(jìn)行處理。靶向分析：在基于質(zhì)譜的代謝組學(xué)分析中，要意識到離子強(qiáng)度和色譜保留時(shí)間都會隨著時(shí)間的推移而產(chǎn)生漂移，所以在實(shí)驗(yàn)中，要按隨機(jī)順序?qū)颖具M(jìn)行檢測，且數(shù)據(jù)需要在同天同一批次進(jìn)行采集，以減少誤差。四川常規(guī)靶向代謝組學(xué)應(yīng)用