代謝組學究竟是一門什么樣的研究方向？首先定義什么是代謝組學。簡單的說就是研究生物體對內(nèi)外刺激的整體代謝應答規(guī)律。那么為什么代謝組學是基因組，轉(zhuǎn)錄組，蛋白質(zhì)組的下游。我們研究它到底有什么意義。中心法則告訴我們了遺傳信息的流向，的執(zhí)行者蛋白質(zhì)中很多酶參與了體內(nèi)的代謝過程。基因測序數(shù)量太大，而且基因水平解釋問題往往很吃力。因為基因的調(diào)控和生物學事件之間隔了一個很漫長的信號轉(zhuǎn)導過程。蛋白同理，一是蛋白種類巨大，二是蛋白組學發(fā)展進入瓶頸；發(fā)展代謝組是因為代謝物種類只有不到1w種，建立它的差異分析更加簡單，同時在價格等方面更有推廣的意義。代謝組學的研究處于生物信息流的中游。武漢LC-MS／MS非靶向脂質(zhì)組學服務
代謝組學樣本收集植物組織：果實、種子：1）對于含水量高、體積較大的果實（番茄、西瓜、蘋果等）需要先將樣品分成“均勻”的小塊(≈ 200 mg/樣本)分裝至2 mL離心管中，標號后迅速放入液氮中冷凍處理至少15 min。2）對于細小的顆粒種子(擬南芥種子、谷物種子等)，可以先將同一組的植株種子混勻后再分裝(≈ 200 mg/樣本)至離心管中，標號后迅速放入液氮中冷凍處理至少15 min。3）對于要求對整個果實進行提取的（整粒葡萄等），需要把果實裝在50 mL離心管/自封袋中，標號后迅速放入液氮中冷凍處理至少15min，-80 ℃凍存，干冰寄送。非靶向代謝組學定性分析代謝組學是一個相當有效率的研究工具。
代謝組學樣品收集方法及所需樣本量是什么？根據(jù)不同的檢測要求，需要配合不同的樣本量和樣本采集方法，常規(guī)的方法和單個樣本量如下：(1) 微生物和細胞樣本：細胞迅速猝滅細胞并冷凍保存；單個樣本細胞數(shù)量要求10^6。(2) 動物體液（如尿、血、組織、唾液）：采樣后要迅速預處理，如加入抗凝血劑、防腐劑，并立即冷凍處理（-80 ℃）；單個樣本要求體積為10μL。(3) 植物樣本：采集后迅速冷凍（液氮），然后轉(zhuǎn)入-80℃保存，單個樣本要求質(zhì)量為50mg。
代謝組學是研究關于生物體被擾動后（如基因的改變或環(huán)境變化后）其代謝產(chǎn)物（內(nèi)源性代謝物質(zhì)）種類、數(shù)量及其變化規(guī)律的科學。代謝組學著重研究的是生物整體、組織的內(nèi)源性代謝物質(zhì)的代謝途徑及其所受內(nèi)在或者外在因素的影響及隨時間變化的規(guī)律。代謝組學通過揭示內(nèi)在和外在因素影響下代謝整體的變化軌跡來反映某種病理生理過程中所發(fā)生的一系列生物事件。代謝組學在系統(tǒng)生物學的末端。以人體為例，對基因序列信息研究是基因組學的范疇。轉(zhuǎn)錄組學研究基因在外在或內(nèi)在環(huán)境刺激下不同的表達?；蛐畔⒎g成蛋白質(zhì)后，各種蛋白的形狀、功能、相互關系是蛋白組學的研究范疇。各種營養(yǎng)物質(zhì)經(jīng)過人體的消化、代謝后的代謝物，就是代謝組學的研究范圍。為什么選擇代謝組學作為科研技術手段？
代謝組學發(fā)展前景：較低的費用，是促使代謝組學在臨床上易于接受的另一個原因。與其他“組學”研究相比，代謝組學的費用更低，研究人員可以通過代謝組學研究篩檢出代謝產(chǎn)物，然后采用更昂貴的基因組學和蛋白質(zhì)組學的方法對有意義的代謝產(chǎn)物進一步加以研究。首先，必須識別出代謝產(chǎn)物，這并不是簡單的工作。代謝組學研究比較大的挑戰(zhàn)就在于對代謝產(chǎn)物的識別，這也是比較有趣的方面，而更具挑戰(zhàn)性的工作，是進一步確認所有代謝物的功能。此外，質(zhì)譜分析發(fā)現(xiàn)，代謝產(chǎn)物的同質(zhì)性不高，由于缺乏均勻性，使色譜分析變得更加困難，無法識別出樣品中的未知物質(zhì)。代謝組學 （metabolomics）的出現(xiàn)是生命科學研究的必然。農(nóng)學靶向代謝組學研究內(nèi)容
代謝組學是效仿基因組學和蛋白質(zhì)組學的研究思想。武漢LC-MS／MS非靶向脂質(zhì)組學服務
代謝組學研究方法： 對于代謝產(chǎn)物來說，不只只有質(zhì)譜峰這個特征。更進一步說，質(zhì)譜（MS）并不能檢測出所有的代謝產(chǎn)物，并不是因為質(zhì)譜的靈敏度不夠，而是由于質(zhì)譜只能檢測離子化的物質(zhì)，但有些代謝產(chǎn)物在質(zhì)譜儀中不能被離子化。采用核磁共振（NMR）的方法，可以彌補色譜的不足。過去，只有毒理學方面的研究使用核磁共振，而質(zhì)譜只在植物代謝研究中采用。如今，這兩種方法在代謝組學研究中已經(jīng)普遍使用。為在不同樣品間進行有意義的比較，研究人員必須結(jié)合使用這兩種方法獲得的大量數(shù)據(jù)進行分析。此外，還需要結(jié)合基因組學研究獲得的數(shù)據(jù)。武漢LC-MS／MS非靶向脂質(zhì)組學服務