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貴州農(nóng)學靶向代謝組學服務

來源: 發(fā)布時間:2022-05-10

代謝組學樣本收集指南:1.血漿樣本收集:(1)從合適的靜脈采集血液(典型10mL)到標記的肝素鋰血漿收集管中(肝素鋰用作抗凝劑)。(2)立即于4 °C離心(3000g)20min,上清液即為血漿。(3)離心完畢,取出血漿收集管,取上清液(血漿),分等份(0.5mL或0.1mL),轉(zhuǎn)移到凍存管中(冰上),旋蓋。(4)保存于-80℃冰箱。寄樣需足量干冰。2.血清樣本收集:(1)從合適的靜脈采集血液(典型10mL)到血清收集管中。(2)將血清收集管冰水浴(4℃)凝集至少1h(2h以內(nèi)),記錄凝集時間。(3)將血清收集管放到冷凍離心機中低溫(4℃)離心15min(2500 g)。(4)離心完畢,取出血清收集管,取上清液,分等份(0.5mL或0.1mL),轉(zhuǎn)移到凍存管中(冰上),旋蓋。(5)保存于-80℃冰箱。寄樣需足量干冰。代謝組學主要研究的是各種代謝路徑的底物。貴州農(nóng)學靶向代謝組學服務

代謝組學疾病診斷應用:與基因組學和蛋白質(zhì)組學相比, 代謝組學的研究側(cè)重于相關特定組分的共性,是要涉及研究每一個代謝組分的共性、特性和規(guī)律,目前據(jù)此目標相距甚遠。盡管充滿了挑戰(zhàn),研究人員仍然堅信,與基因組學和蛋白質(zhì)組學相比,代謝組學與生理學的聯(lián)系更加緊密。疾病導致機體病理生理過程變化,引起代謝產(chǎn)物發(fā)生相應的改變,通過對某些代謝產(chǎn)物進行分析,并與 正常人的代謝產(chǎn)物比較,尋找疾病的生物標記物,將提供一種較好的疾病診斷方法。北京脂質(zhì)代謝組學多研究內(nèi)容代謝組學關注的對象是分子量在1000以下的小分子化合物。

代謝組學發(fā)展前景:代謝組學是繼基因組學、蛋白質(zhì)組學、轉(zhuǎn)錄組學后出現(xiàn)的新興“組學”,每年發(fā)表的代謝組學研究的文章數(shù)量都在不斷增加。代謝組學的發(fā)展很迅速,盡管還沒有經(jīng)典論文出現(xiàn),但是研究人員相信,與基因組學和蛋白質(zhì)組學相比,代謝組學將在臨床上發(fā)揮更大的作用。許多公司通過市場研究發(fā)現(xiàn),健康人并不希望進行基因型分析,所以,對于這些人群來說,基因組學研究在臨床上的應用很有限。而代謝組學與臨床化學較為相似,且相對于基因組學來說,提供的個人信息更少,故其在臨床上的應用有可能產(chǎn)生一定的影響。

代謝組學的功能:代謝組學的功能,就有點類似GPS。代謝組學不做任何假設,針對樣本和參照物分別進行代謝物全譜檢測,幫你尋找出與差異代謝物,可能會有好幾十個甚至更多,從它們所在的被上調(diào)或下調(diào)的代謝通路上去找到關鍵的代謝酶,再找到它們上游的調(diào)控基因,再進行后續(xù)的深入研究,是不是可以避免走一些彎路?可以說代謝組學是一個相當有效率的研究工具。代謝組學在生物標志物的發(fā)現(xiàn),疾病早期診斷和預測,藥物或營養(yǎng)干預的評價,藥物毒性評價,代謝工程研究中均有應用,但代謝組學只是一個“檢測平臺”,它無法單獨開展機制性研究,但是如果合理的將代謝組學與分子生物學等學科協(xié)同使用,就可以起到事半功倍的作用。代謝組學著重研究的是生物整體或組織的內(nèi)源性代謝物質(zhì)的代謝途徑。

LC-MS非靶向代謝組學:LCMS非靶向是通過液質(zhì)聯(lián)用(LC–MS)方法檢測生物體受擾動或刺激前后大量代謝產(chǎn)物的動態(tài)變化,從中找出表達差異的代謝物,進而闡明生物體代謝相關過程的代謝組學技術(shù)。LCMS非靶向代謝組學適用于分析難揮發(fā)或熱穩(wěn)定性差的代謝產(chǎn)物,具有高通量、高分辨率、高靈敏度的特點。超高壓液相色譜或超高效液相色譜(UPLC)通過采用更小粒徑的色譜填料配合更高的壓力,實現(xiàn)了更好的分離,具體包括更高的分離能力、更快的分離速度以及更好的靈敏度;串聯(lián)質(zhì)譜儀在MS掃描模式下,可實現(xiàn)高低碰撞能量快速切換,同時采集代謝物的一二級質(zhì)譜信息,結(jié)合代謝組學數(shù)據(jù)處理軟件對質(zhì)譜信息的解析,在單次分析中可檢測和鑒定幾百至幾千種代謝物。與其他“組學”研究相比,代謝組學的費用更低。廣州LC-MS/MS非靶向代謝組學分析

代謝組學作為系統(tǒng)生物學的一個重要的分支,與其他組學相比有著其特有的優(yōu)勢。貴州農(nóng)學靶向代謝組學服務

選擇代謝組學作為科研技術(shù)手段的優(yōu)勢有哪些?1、代謝組學的研究處于生物信息流的中游,介于基因、蛋白質(zhì)和細胞、組織之間,在生物信息的傳遞中起到承上啟下的作用。2、小分子的產(chǎn)生和代謝是基因表達的下游產(chǎn)物,生物體液的代謝產(chǎn)物分析能夠更直接,更準確的反映生物體的病理生理狀態(tài)。3、代謝物的種類少,大約在103個數(shù)量級,要遠小于基因和蛋白質(zhì)的數(shù)據(jù),物質(zhì)的分子結(jié)構(gòu)要簡單得多,分析起來更簡單明了。4、代謝組學的代謝物信息庫簡單,它遠沒有全基因組測序及大量表達序列標簽的數(shù)據(jù)庫那么復雜。5、基因和蛋白質(zhì)表達的有效微小變化會在代謝物上得到放大,從而使檢測更容易。6、代謝產(chǎn)物在各個生物體系中都是類似的,所以代謝組學研究中采用的技術(shù)更容易在各個領域中通用,也更容易被人接受。貴州農(nóng)學靶向代謝組學服務

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