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湖北農學靶向代謝組學鑒定

來源: 發(fā)布時間:2022-05-12

代謝組學的概念:代謝組學的概念來源于代謝組,代謝組是指某一生物或細胞在一特定生理時期內所有的低分子量代謝產(chǎn)物,代謝組學則是對某一生物或細胞在一特定生理時期內所有低分子量代謝產(chǎn)物同時進行定性和定量分析的一門新學科。它是以組群指標分析為基礎,以高通量檢測和數(shù)據(jù)處理為手段,以信息建模與系統(tǒng)整合為目標的系統(tǒng)生物學的一個分支。 代謝組學主要研究的是作為各種代謝路徑的底物和產(chǎn)物的小分子代謝物(MW<1000)。 在食品安全領域,利用代謝組學工具發(fā)現(xiàn)農獸藥等在動植物體內的相關生物標志物也是一個熱點領域。其樣品主要是動植物的細胞和組織的提取液。主要技術手段是核磁共振,質譜,色譜,其中以NMR為主。通過檢測一系列樣品的NMR 譜圖,再結合模式識別方法,可以判斷出生物體的病理生理狀態(tài),并有可能找出與之相關的生物標志物。為相關預警信號提供一個預知平臺。在食品安全領域,利用代謝組學工具發(fā)現(xiàn)農獸藥等在動植物體內的相關生物標志物也是一個熱點領域。湖北農學靶向代謝組學鑒定

代謝組學比較常用到的數(shù)據(jù)分析方法:代謝組學分析數(shù)據(jù)用于統(tǒng)計分析時,數(shù)據(jù)集通常為一個N × K的矩陣(X矩陣),N表示N個樣本數(shù),每一行表示一個樣品, K表示K個變量,每一列表示一個變量,在代謝組學中變量通常是指代謝物含量。單變量分析方法只分別分析單個變量,不考慮多個變量的相互作用與內在聯(lián)系。具有簡單性、易應用性和可解釋性。但是無法基于整體數(shù)據(jù)對所測樣品的優(yōu)劣、差異進行綜合評價和分析。差異倍數(shù)變化大小(Fold Change,F(xiàn)C)表示實驗組與對照組的含量比值,可以快速考察各個代謝物在不同組別之間的含量變化大小。貴陽農學靶向代謝組學分析與基因組學和蛋白質組學相比,代謝組學的研究側重于相關特定組分的共性。

代謝組學概念:代謝組學主要研究的是作為各種代謝路徑的底物和產(chǎn)物的小分子代謝物(MW<1000)。 在食品安全領域,利用代謝組學工具發(fā)現(xiàn)農獸藥等在動植物體內的相關生物標志物也是一個熱點領域。其樣品主要是動植物的細胞和組織的提取液。主要技術手段是核磁共振(NMR),質譜(MS),色譜(HPLC,GC),其中以NMR為主。通過檢測一系列樣品的NMR 譜圖,再結合模式識別方法,可以判斷出生物體的病理生理狀態(tài),并有可能找出與之相關的生物標志物(biomarker)。

非靶向代謝組學:新陳代謝網(wǎng)絡是復雜的網(wǎng)絡,特別是人體的代謝網(wǎng)絡,一直被認為是相對復雜的代謝網(wǎng)絡?,F(xiàn)在多數(shù)信號通路的研究是集中在代謝網(wǎng)絡的一個很小的領域。基因組學、蛋白組學研究已經(jīng)揭示了部分調節(jié)通路,但是和代謝網(wǎng)絡直接相關的是代謝產(chǎn)物。從多種代謝產(chǎn)物中選取研究對象,無疑是困難的。非靶向代謝組學又稱為發(fā)現(xiàn)代謝組學,主要是將對照組和實驗組的代謝組(某一生物體的全部代謝物)進行比對,以找出其代謝物的差異。代謝組學研究通過一定的手段能夠幫助研究員從代謝產(chǎn)物海中跳出來,提供一個“航拍”的視角,從而發(fā)現(xiàn)差異性代謝產(chǎn)物。然后通過已知的代謝通路逆推找出調節(jié)酶和基因,完成疾病發(fā)病機制、藥物療理機制等方面的研究。LC-MS非靶向代謝組的優(yōu)勢有什么?

GC-MS非靶向代謝組學能檢測到哪些類別的代謝物?衍生化極大地拓展了GC/MS的檢測分析范圍。GC/MS能檢測到有機酸、氨基酸、單糖、糖醇、胺類、脂肪酸、吲哚、單甘油酯、核苷、二糖、生育酚、甾醇和膽汁酸等代謝物。如何提高定性準確度?GC/MS的定性有雙重標準,一是保留指數(shù),二是質譜信息的相似度(similarity)。不同于LC/MS的軟電離源,GC/MS使用的EI源屬于硬電離,能量較強且穩(wěn)定,在將代謝物分子電離后,分子離子峰進一步碎裂產(chǎn)生豐富的碎片離子。因此,我們很難在GC/MS上看到分子離子峰。GC/MS提供的是代謝物的“指紋圖譜”,將儀器得到的實際指紋圖譜和質譜庫(如NIST庫)進行比對后,我們將會得到一個叫相似度的指標。保留指數(shù)和相似度都必須滿足設定的閾值,軟件才會給出色譜峰的定性結果。然后采用標準品質譜信息進行完全比對定性,也就是說只有經(jīng)過標準品比對,代謝物才是被100%定性。選擇代謝組學作為科研技術手段的優(yōu)勢有哪些?湖北常規(guī)靶向代謝組學費用

代謝組學有哪些特點?湖北農學靶向代謝組學鑒定

代謝組學有哪些應用?近年來,代謝組學技術得到了迅速發(fā)展,主要可應用于:功能基因組學、疾病早期診斷、病因病機研究、藥物毒理學、中醫(yī)藥現(xiàn)代化、植物代謝組學、微生物代謝組學、營養(yǎng)學、環(huán)境科學等生命科學的各個領域。為什么要選擇代謝組學?首先需要明確的是代謝組學的目標分析物主要為生物小分子及其代謝產(chǎn)物,如糖、有機酸、脂質、維生素、氨基酸、芳香烴之類等化合物。所以,如果關注的是小分子物質,那么采用代謝組學的方法,可以對樣品內檢測到的小分子物質進行定性、定量分析。同于基因組學和蛋白組學,代謝組學的研究反映某一時刻下正在發(fā)生的生命活動情況,研究代謝物的表達量、代謝物與生理病理變化的關系,能夠幫助尋找新的生物標記物,發(fā)現(xiàn)新的代謝途徑,以及更進一步深入了解目前已知的這些途徑,應用于疾病的早期診斷、藥物靶點的發(fā)現(xiàn)、疾病的病理生理研究。湖北農學靶向代謝組學鑒定

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