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哈爾濱蛋白質(zhì)丙二?;揎椊M學

來源: 發(fā)布時間:2022-05-26

泛素化修飾PRM定量驗證:原理: 泛素化修飾是一種重要的翻譯后修飾。泛素-蛋白酶體系統(tǒng)介導了真核生物體內(nèi)80%~85%的蛋白質(zhì)降解。此外,泛素化修飾還可以直接影響蛋白質(zhì)的活性和定位,調(diào)控包括細胞周期、細胞凋亡、轉(zhuǎn)錄調(diào)控、DNA 損傷修復以及免疫應答等在內(nèi)的多種細胞活動。首先對泛素化的蛋白進行胰酶消化,在賴氨酸的修飾位點上會產(chǎn)生兩個甘氨酸的殘基(K-GG),利用對泛素化賴氨酸(K-GG)具有高親和力的基序抗體,特異性富集復雜樣本中的泛素化肽段,結(jié)合LC-MS/MS蛋白質(zhì)定量方法,實現(xiàn)大規(guī)模泛素化蛋白質(zhì)定性定量分析。蛋白質(zhì)翻譯后修飾組學是什么?哈爾濱蛋白質(zhì)丙二?;揎椊M學

蛋白翻譯后修飾位點鑒定:蛋白質(zhì)翻譯后修飾(Post-Translational Modifications, PTMs)幾乎參與了細胞所有正常生命活動的過程,并發(fā)揮十分重要的調(diào)控作用。蛋白質(zhì)修飾位點能夠影響蛋白的多種屬性,包括蛋白質(zhì)折疊、活性以及之后的功能,對于蛋白質(zhì)修飾位點的發(fā)現(xiàn)及研究對闡明蛋白質(zhì)的功能具有重要作用。技術(shù)特點:時間快,周期短;識別位點準確,采用高分辨率質(zhì)譜技術(shù)可以準確定位到發(fā)生修飾的氨基酸位點。適用范圍:已知蛋白序列;明確翻譯后修飾的類型。湖北蛋白質(zhì)糖基化修飾組學研究磷酸化修飾蛋白質(zhì)組的研究主要集中于真核生物中普遍存在的絲氨酸、蘇氨酸和酪氨酸的磷酸化。

定量磷酸化蛋白質(zhì)翻譯修飾組學:蛋白質(zhì)發(fā)生磷酸化是重要的翻譯后修飾,它與信號傳導、細胞周期、生長發(fā)育機理等諸多生物學問題有密切關(guān)系。研究蛋白質(zhì)磷酸化對闡明蛋白質(zhì)功能具有重要意義。將磷酸化肽段TiO2富集技術(shù)和iTRAQ/TMT/Lable free技術(shù)相結(jié)合,實現(xiàn)對磷酸化蛋白質(zhì)組學的定量研究。技術(shù)原理:在磷酸化肽段富集前先進行 iTRAQ/TMT 標記,然后通過 TiO2 富集方法獲得高純度的磷酸化肽段,之后結(jié)合高分辨率質(zhì)譜完成對樣品的定量分析。

泛素化修飾蛋白質(zhì)組學有些什么?泛素化可以生產(chǎn)出單泛素化或多泛素化蛋白質(zhì)。后者在當7個賴氨酸殘基的泛素與另一個泛素的甘氨酸C端連接形成。這種泛素分子鏈接在生物過程中起到重要的作用。共價結(jié)合泛素的蛋白質(zhì)能被蛋白酶識別并降解,這是細胞內(nèi)短壽命蛋白質(zhì)和一些異常蛋白降解的普遍途徑。泛素化及類泛素化蛋白在細胞分裂,自噬,DNA修復,免疫應答,細胞消亡等方面同樣起到關(guān)鍵作用。與消化道內(nèi)進行的蛋白質(zhì)水解不同,從泛素與蛋白的結(jié)合到將蛋白水解成小的肽段,整個水解過程需要能量參與。人們開始意識到泛素-蛋白酶系統(tǒng)是一個對于真核細胞非常重要的調(diào)節(jié)系統(tǒng)。磷酸化修飾蛋白質(zhì)組學是原核生物和真核生物中比較重要的調(diào)控修飾形式。

定量N-糖基化蛋白質(zhì)翻譯修飾組學:蛋白質(zhì)的N-糖基化位點修飾是重要的蛋白質(zhì)翻譯后修飾之一,主要在復雜的多細胞或組織形成過程中起關(guān)鍵作用。蛋白質(zhì)的N-糖基化修飾位點具有保守的氨基酸序列NX(S/T)(其中X為除脯氨酸以外的其它氨基酸)凝集素親和法是目前糖蛋白質(zhì)組學中應用普遍的分離富集方法。凝集素(lectin)是一類糖結(jié)合蛋白質(zhì),能專一識別某一特殊結(jié)構(gòu)的單糖或聚糖中特定的糖基序列而與之結(jié)合,它們與糖鏈可逆非共價結(jié)合,糖蛋白或糖肽被凝集素捕獲之后,通常用特定的單糖通過競爭結(jié)合凝集素將糖蛋白或糖肽洗脫下來。蛋白質(zhì)翻譯后修飾PTMs通常包括磷酸化,糖基化,泛素化,亞硝基化,甲基化,乙?;?,脂質(zhì)化和蛋白水解。蛋白質(zhì)琥珀?;揎椊M學主要方式

蛋白質(zhì)翻譯后修飾組學的特征,雖然具有挑戰(zhàn)性,但提供了對病因?qū)W過程下的細胞功能的無價的洞察。哈爾濱蛋白質(zhì)丙二?;揎椊M學

泛素化修飾蛋白質(zhì)組學的介紹:泛素由76個氨基酸組成,高度保守,普遍存在于真核細胞內(nèi),故名泛素。泛素化是可逆的,依賴ATP并且通過泛素刺激酶E1,泛素結(jié)合酶E2,泛素連接酶E3一系列催化反應所致。這些特殊的酶包括泛素酶,結(jié)合酶、連結(jié)酶和降解酶等。泛素化在蛋白質(zhì)的定位、代謝、功能、調(diào)節(jié)和降解中都起著十分重要的作用。同時,它也參與了細胞周期、增殖、凋亡、分化、轉(zhuǎn)移、基因表達、轉(zhuǎn)錄調(diào)節(jié)、信號傳遞、損傷修復、炎癥免疫等幾乎一切生命活動的調(diào)控。泛素化、心血管等疾病的發(fā)病密切相關(guān)。因此,作為近年來生物化學研究的一個重大成果,它已然成為研究、開發(fā)新藥物的新靶點。哈爾濱蛋白質(zhì)丙二酰化修飾組學

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