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北京蛋白組學(xué)ppt

來源: 發(fā)布時間:2022-05-30

蛋白質(zhì)組數(shù)據(jù)分析鑒定出了幾種參與肝葡萄糖脂代謝的蛋白質(zhì)(ACC、FASN、SCD1、CPT1A、GLUT2、GK、GS、G6Pase、PEPCK)。此外,AC顯示出抑制脂肪生成酶(ACC,F(xiàn)ASN和SCD1)表達(dá)的趨勢,同時***上調(diào)了GLUT2。與對照組相比,AC***增加了PEPCK的表達(dá),兩種化學(xué)物質(zhì)對G6Pase均無***影響(圖4A)。PRM蛋白靶向驗(yàn)證測定結(jié)果與蛋白質(zhì)組變化相一致,這進(jìn)一步證實(shí)了蛋白質(zhì)組學(xué)數(shù)據(jù)中蛋白質(zhì)的表達(dá)(圖4B)。轉(zhuǎn)錄組學(xué)和蛋白質(zhì)組學(xué)聯(lián)合分析結(jié)果顯示AC和AL***改善了線粒體功能。GSEA分析顯示,處理組的氧化磷酸化(OXPHOS)通路***上調(diào),AC組和AL組的富集得分分別為0.826和0.535。蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù)簡介及應(yīng)用場景。北京蛋白組學(xué)ppt

蛋白組學(xué)研究案例:2022年1月,歐易/鹿明生物合作客戶北京中醫(yī)藥大學(xué)教育部中醫(yī)養(yǎng)生學(xué)重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室劉銅華教授課題組在Frontiers in Nutrition期刊發(fā)表了題為 “Mechanisms for Improving Hepatic Glucolipid Metabolism by Cinnamic Acid and Cinnamic Aldehyde: An Insight Provided by Multi-Omics ”的研究成果,通過轉(zhuǎn)錄組學(xué)和蛋白質(zhì)組學(xué)研究方法,發(fā)現(xiàn)了肉桂酸(AC)和肉桂醛(AL)在改善葡萄糖脂代謝中的特征,探究了其代謝作用機(jī)理。為預(yù)防和***代謝紊亂等疾病提供了理論依據(jù)。上海pulldown蛋白組學(xué)蛋白質(zhì)組學(xué)質(zhì)譜分析蛋白質(zhì)組學(xué)三大基本技術(shù)。

本研究通過生理和蛋白質(zhì)組學(xué)分析在冬油菜中鑒定了大量的冷脅迫響應(yīng)蛋白。探討了冬油菜耐凍性增強(qiáng)的機(jī)理和低溫脅迫對冬油菜形態(tài)和生理生化變化的影響。文章以耐凍型Longyou 7和冷敏感型Lenox為材料,通過iTRAQ標(biāo)記蛋白組學(xué)和轉(zhuǎn)錄組學(xué)分析,揭示了谷胱甘肽轉(zhuǎn)移酶活性、碳水化合物結(jié)合和谷胱甘肽結(jié)合、代謝過程及IAA反應(yīng)與冷應(yīng)激反應(yīng)密切相關(guān),鑒定出了Longyou 7和Lenox之間的DAPs,這些DAPs參與氨基酸、碳水化合物、脂質(zhì)和能量代謝,對提高冬油菜的耐凍性發(fā)揮了重要作用。

運(yùn)用生物技術(shù):TMT標(biāo)記定量蛋白質(zhì)組學(xué)、PRM蛋白靶向驗(yàn)證由鹿明生物提供技術(shù)支持:2021年12月,上海交通大學(xué)張荻課題組在Frontiers in Plant Science發(fā)表題為 TMT-Based Quantitative Proteomic Analysis Reveals the Physiological Regulatory Networks of Embryo Dehydration Protection in Lotus(Nelumbo nucifera)的研究成果,通過TMT標(biāo)記蛋白質(zhì)組學(xué)和平行反應(yīng)監(jiān)測蛋白靶向驗(yàn)證(PRM)技術(shù)研究方法,構(gòu)建了蓮花胚胎脫水保護(hù)的生理調(diào)控網(wǎng)絡(luò)。為揭示荷花種子長壽的脫水保護(hù)機(jī)制提供了新的見解。靶向蛋白質(zhì)組學(xué),信號通路蛋白靶點(diǎn)高通量分析。

本文為了探究其潛在的分子機(jī)制,作者運(yùn)用RNA測序(RNA-seq)和iTRAQ標(biāo)記定量蛋白組學(xué),對不同成熟度水平的油脂種子進(jìn)行了研究。不僅揭示了關(guān)鍵候選基因和蛋白質(zhì)的時間特異性表達(dá),而且為該樹種的遺傳改良提供了科學(xué)依據(jù)。中文標(biāo)題:基于iTRAQ蛋白質(zhì)組學(xué)和轉(zhuǎn)錄組學(xué)聯(lián)合分析揭示油茶種子成熟過程中油質(zhì)相關(guān)的關(guān)鍵代謝產(chǎn)物的積累研究對象:油茶種子發(fā)表期刊:HorticultureResearch影響因子:6.793發(fā)表時間:2021.07.01發(fā)表單位:海南大學(xué)園藝園林學(xué)院運(yùn)用生物技術(shù):RNA測序(RNA-seq)和iTRAQ標(biāo)記定量蛋白組學(xué)、轉(zhuǎn)錄組學(xué)、蛋白組學(xué)文章中iTRAQ標(biāo)記定量蛋白組學(xué)由歐易/鹿明生物提供技術(shù)支持蛋白質(zhì)組學(xué)生物標(biāo)志物&機(jī)制研究一站式服務(wù)。天津修飾蛋白組學(xué)

蛋白組學(xué)常見研究模式,蛋白樣本準(zhǔn)備注意事項(xiàng)以及經(jīng)典案例解讀。北京蛋白組學(xué)ppt

作者通過iTRAQ蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù)鑒定敲低NMT1后發(fā)生變化的蛋白質(zhì)。結(jié)果鑒定到三種上調(diào)蛋白(LXN,RPL29andFAU)和六種下調(diào)蛋白(NMT1,MTPN,AHSG,ALB,GON7andTF)(圖2A)。作者將這些蛋白質(zhì)分別命名為N-豆蔻?;抡{(diào)蛋白(NDP)和上調(diào)蛋白(NUP)。有趣的是,敲低NMT1會減少NDP和NUP的N-豆蔻?;?,而過表達(dá)NMT1會誘導(dǎo)NDP和NUP的N-豆蔻?;▓D2B)。在小鼠模型中,敲除NMT1會導(dǎo)致NDP和NUP的去N-豆蔻?;?,這可以通過在肝臟中表達(dá)外源性NMT1來部分逆轉(zhuǎn)(圖2C)。這些發(fā)現(xiàn)表明,盡管NMT1對NDP和NUP的表達(dá)起著相反的作用,但NMT1同時刺激NDP和NUP的N-豆蔻?;?。北京蛋白組學(xué)ppt

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