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吉林蛋白組學技術

來源: 發(fā)布時間:2022-06-24

綜上所述,本研究應用RNA-seq轉錄組分析結合iTRAQ蛋白質(zhì)組學技術,探討油茶種子不同成熟期儲量積累的動態(tài)變化。此外,作者還探討了黃酮類化合物和脂肪酸的生物合成和代謝可能的調(diào)控機制。許多功能轉錄本(16530)和蛋白質(zhì)物種(1228)的模式發(fā)生了***變化,其中317個DAPs被轉錄組結果覆蓋。結合結構基因(蛋白)或轉錄因子的表達譜及相應化合物的含量,對重要代謝產(chǎn)物的調(diào)控網(wǎng)絡進行了探討。結果表明,黃酮類化合物的合成能力在種子成熟過程中逐漸減弱,而脂肪酸的合成能力則先升高后下降。蛋白組學翻譯后修飾篩選,檢測,鑒定,定性,定量。吉林蛋白組學技術

運用生物技術:TMT標記定量蛋白質(zhì)組學、PRM蛋白靶向驗證由鹿明生物提供技術支持:2021年12月,上海交通大學張荻課題組在Frontiers in Plant Science發(fā)表題為 TMT-Based Quantitative Proteomic Analysis Reveals the Physiological Regulatory Networks of Embryo Dehydration Protection in Lotus(Nelumbo nucifera)的研究成果,通過TMT標記蛋白質(zhì)組學和平行反應監(jiān)測蛋白靶向驗證(PRM)技術研究方法,構建了蓮花胚胎脫水保護的生理調(diào)控網(wǎng)絡。為揭示荷花種子長壽的脫水保護機制提供了新的見解。吉林蛋白組學技術蛋白質(zhì)組學,Label Free/iTRAQ/dia/MRM/PRM。

蛋白質(zhì)是生命活動的主要執(zhí)行者,而蛋白質(zhì)磷酸化修飾是生物體內(nèi)**重要的共價修飾方式之一,真核生物體內(nèi)有超過三分之一的蛋白可以發(fā)生磷酸化修飾。蛋白質(zhì)的磷酸化和去磷酸化這一可逆過程調(diào)節(jié)著包括細胞增殖、發(fā)育、分化、信號轉導、細胞凋亡、神經(jīng)活動、肌肉收縮及**發(fā)生等過程在內(nèi)的所有生命活動。單一的磷酸化蛋白質(zhì)組學只能解釋蛋白磷酸化水平發(fā)生的變化,而[黃金搭檔]——蛋白質(zhì)組與磷酸化蛋白質(zhì)組聯(lián)合分析,則在揭示疾病相關特性、篩選疾病生物標志物、尋找藥物靶點等方面發(fā)揮了更加重要的作用。

采用RNA-Seq轉錄組學分析和DIA蛋白質(zhì)組學分析,研究了AC和AL對db/db小鼠的影響。轉錄組分析共鑒定出16812種不同的蛋白質(zhì)編碼轉錄本。其中,2837個(約16.9%)在正常組和對照組之間有***差異,表明db/db小鼠在轉錄水平上與野生型小鼠***不同。與對照組相比,共有3749個基因因攝入AC而發(fā)生***改變(2201個下調(diào),1548個上調(diào)),560個基因(430個下調(diào),130個上調(diào))因攝入AL而發(fā)生***改變(圖3B)。DIA蛋白質(zhì)組學分析鑒定出2729種蛋白質(zhì)。正常組和對照組之間共發(fā)現(xiàn)1059個(約占總鑒定蛋白質(zhì)的38.8%)DEPs,AC處理有230個蛋白質(zhì)發(fā)生***變化(109個上調(diào),121個下調(diào)),AL處理有211個蛋白質(zhì)發(fā)生***變化(116個上調(diào),95個下調(diào))。蛋白組學近期研究進展的盤點。

蛋白質(zhì)組定量到了10,529種蛋白質(zhì),磷酸化蛋白質(zhì)組定量到了來自9,832個磷酸化蛋白的62,879個磷酸化位點?;蚪M確定了包括TP53、KRAS、FGFR2、IDH1/2、BAP1、ARID1A和PBRM1在內(nèi)的16個***改變的**驅(qū)動基因(圖1A)。與西方iCCA人群隊列相比,本文隊列顯示出更高的KRAS突變頻率和更低的IDH1、ARID1A和TERT突變頻率(圖1B)。在FU-iCCA隊列中觀察到黃曲霉***和馬兜鈴酸特征(圖1C)。通過比較具有或不具有黃曲霉***特征的所有**的多組學數(shù)據(jù),發(fā)現(xiàn)具有黃曲霉***特征的**顯示出DNA修復和細胞周期通路的上調(diào)以及細胞凋亡、***炎癥和免疫通路的下調(diào)(圖1E)。進一步分析顯示,TP53突變與黃曲霉***特征***相關(圖1F和1G)。蛋白組學—精選文章推薦。北京蛋白組學

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中文標題:肉桂酸和肉桂醛改善肝葡萄糖脂代謝的機制:多組學提供的見解研究對象:小鼠發(fā)表期刊:FrontiersinNutrition影響因子:6.576發(fā)表時間:2022年1月11日合作單位:北京中醫(yī)藥大學健康培養(yǎng)教育部重點實驗室,北京中醫(yī)藥大學健康栽培北京市重點實驗室,北京中醫(yī)藥大學科學技術系運用組學關鍵技術:轉錄組學、DIA蛋白組學、PRM靶向蛋白驗證(皆由歐易/鹿明生物提供技術支持)。目前,改善飲食被認為是**安全有效的***和預防代謝性疾病的方法,其中肉桂(主要是肉桂屬植物八角肉桂和桂皮)及其成分被證明具有多種***作用,包括抗糖尿病、減輕體重、低脂血癥和增強胰島素敏感性。因此,使用膳食補充劑和來自肉桂的化學物質(zhì)來控制血糖和血脂可能成為***代謝類疾病的新方法。吉林蛋白組學技術

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