GC-MS非靶向代謝組研究,隨著納米材料的產(chǎn)業(yè)化,各種形式的納米材料將以不同途徑進入人們的生活,納米材料的生物安全性問題正受到世界各國科學家的***關注,本篇為2020年2月,南京大學趙麗娟課題組在Environmental Science & Technology雜志發(fā)表題為“Silver Nanoparticles Alter Soil Microbial Community Compositions and Metabolite Profiles in Unplanted and Cucumber-planted Soil”的研究論文。該研究運用16S rRNA基因測序、GC-MS非靶向代謝組技術對土壤微生物組和代謝組學分析技術的獨特結合,提供了對AgNPs生態(tài)影響的全新視角,***了解了AgNPs暴露對土壤微生物的影響。代謝組學-歐易生物-鹿明生物-專業(yè)技術團隊-值得信賴。江蘇代謝組學的應用并舉例
非靶代謝組學研究:2022年03月,歐易/鹿明生物合作客戶重慶醫(yī)科大學附屬第二醫(yī)院消化內(nèi)科周智航團隊在International Journal of Biological Sciences期刊發(fā)表的題為 “Enhanced pentose phosphate pathway activity promotes pancreatic ductal adenocarcinoma progression via activating YAP/MMP1 axis under chronic acidosis”的研究成果,通過采用非靶代謝組學和基因表達芯片,發(fā)現(xiàn)了適應酸性微環(huán)境的胰腺導管腺* (PDAC)細胞具有更強的轉(zhuǎn)移和增殖能力。
代謝組學顯示適應酸性微環(huán)境的 PDAC 細胞中葡萄糖增加、糖酵解減少,而轉(zhuǎn)錄組學發(fā)現(xiàn)適應酸性微環(huán)境細胞中的差異表達基因主要為細胞外基質(zhì)修飾和 Hippo 信號傳導相關基因。MMP1 在在適應酸性微環(huán)境細胞中上調(diào)**為明顯,實驗驗證了其由 YAP/TAZ 通路介導,而被 AMPK抑制。該研究確認了代謝重編程通過AMPK/ YAP /MMP1軸促進適應酸性微環(huán)境的 PDAC 細胞的增殖和轉(zhuǎn)移。 浙江代謝組學檢測范圍代謝組學生物解析 非靶代謝組學研究 靶向代謝組學研究。
代謝組學研究:濃香型白酒(SFB)在窖泥窖內(nèi)發(fā)酵過程中,獲得了其特有的風味。窖泥中的微生物是產(chǎn)生風味酯的關鍵前提物。本篇為歐易/鹿明生物合作客戶四川省農(nóng)業(yè)科學院水稻高粱研究所(一作:劉茂柯)于2020年3月在微生物學專刊《mSystems》(IF=6.469)發(fā)表的題為“Structural and Functional Changes in Prokaryotic Communities in Artificial Pit Mud during Chinese Baijiu Production”的研究報道,該研究對釀造微生態(tài)系統(tǒng)進行了***16S rRNA測序,蛋白質(zhì)組學和代謝組學聯(lián)合分析。運用多組學方法能夠更***地了解高質(zhì)量濃香白酒生產(chǎn)過程中人工窖泥微生物群落發(fā)生的代謝過程變化,這將有助于進一步優(yōu)化人工窖泥培養(yǎng)技術和改善濃香白酒的質(zhì)量。
代謝組學+轉(zhuǎn)錄組學研究:2022年2月,中國海洋大學食品科學與工程學院劉尊英教授課題組在《Foods》期刊發(fā)表的題為“Dissecting of the AI-2/LuxS Mediated Growth Characteristics and Bacteriostatic Ability of Lactiplantibacillus plantarum SS-128 by Integration of Transcriptomics and Metabolomics”的研究成果,通過轉(zhuǎn)錄組學和代謝組學等研究方法,發(fā)現(xiàn)植物乳孢桿菌可以通過AI-2/luxs介導的群體感應(QS)系統(tǒng)來調(diào)節(jié)其生長特性和代謝,該系統(tǒng)是參與食品安全的正調(diào)控因子,這將有助于研究植物乳孢桿菌的生物保護控制潛力,特別是在食品工業(yè)生物技術中的應用。代謝組學-對生物體內(nèi)所有代謝物進行定量分析。
LC-MS+GC-MS雙平臺代謝組學研究案例,中文標題:使用無偏差代謝組學方法鑒定短期暴露于顆粒物和微生物氣溶膠中的青年人尿液生物標志物研究對象:年輕健康志愿者發(fā)表期刊:EnvironmentalPollution影響因子:8.071發(fā)表時間:2022年4月17日合作單位:中國醫(yī)學科學院醫(yī)藥生物技術研究所衛(wèi)計委***生物工程重點實驗室、中國中醫(yī)科學院廣安門醫(yī)院運用生物技術:LC-MS代謝組學、GC-MS代謝組學(由鹿明生物提供技術支持)。本研究旨在使用LC-MS+GC-MS雙平臺代謝組學研究方法探索 92 名年輕健康個體的尿液代謝組學特征,并確定與短期共暴露相關的潛在生物標志物。代謝組學大起底—探究小分子物質(zhì)研究。上海代謝組學與微生物
代謝組學 生物標志物挖掘?qū)<?歐易生物。江蘇代謝組學的應用并舉例
土壤代謝組學:銀納米顆粒(AgNPs)是使用*****的工程納米材料之一,泄露可能導致顆粒在土壤中積累,并對環(huán)境造成未知風險。有報告指出AgNPs可能通過影響根系分泌物間接對微生物群落功能和基因組多樣性產(chǎn)生***影響,但對其機理了解甚少。土壤代謝物可作為土壤微生物群落變化的表型特征,但當前有關NPs暴露對土壤微生物群落影響的研究不包括對土壤代謝產(chǎn)物的分析。16S rRNA基因序列可以提供改變的土壤微生物群相關信息,鑒于它們的已知功能,人們可以對土壤生物化學的變化提出合理假設。本文作者利用16S rRNA基因測序和非靶向代謝組學方法,研究了AgNPs對土壤微生物群落的長期影響。江蘇代謝組學的應用并舉例
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