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上海代謝組學(xué)的數(shù)據(jù)處理

來源: 發(fā)布時間:2022-07-22

土壤代謝組學(xué):銀納米顆粒(AgNPs)是使用*****的工程納米材料之一,泄露可能導(dǎo)致顆粒在土壤中積累,并對環(huán)境造成未知風(fēng)險。有報告指出AgNPs可能通過影響根系分泌物間接對微生物群落功能和基因組多樣性產(chǎn)生***影響,但對其機理了解甚少。土壤代謝物可作為土壤微生物群落變化的表型特征,但當(dāng)前有關(guān)NPs暴露對土壤微生物群落影響的研究不包括對土壤代謝產(chǎn)物的分析。16S rRNA基因序列可以提供改變的土壤微生物群相關(guān)信息,鑒于它們的已知功能,人們可以對土壤生物化學(xué)的變化提出合理假設(shè)。本文作者利用16S rRNA基因測序和非靶向代謝組學(xué)方法,研究了AgNPs對土壤微生物群落的長期影響。代謝組學(xué) 尋找代謝物與生理病理的研究方式。上海代謝組學(xué)的數(shù)據(jù)處理

作者研究發(fā)現(xiàn)**酸過量會導(dǎo)致葡萄酒顏色變淺,但**酸干擾對酵母細胞繁殖和β-葡萄糖苷酶活性均無***影響,隨后通過非靶代謝組學(xué)、靶向代謝組學(xué)等技術(shù)研究**酸干擾過程中葡萄酒代謝物的變化,發(fā)現(xiàn)**酸過量會干擾酒精發(fā)酵過程中花青素的代謝,通過加速其異構(gòu)化來削弱花青素濃度,從而影響葡萄酒色澤,因而在葡萄酒生產(chǎn)中過程中應(yīng)避免**酸過量。通過非靶代謝組學(xué)技術(shù),能夠了解發(fā)酵過程中,發(fā)酵液代謝物的變化情況。了解到在糖酵解過程中,多余的PA會擾亂糖酵解和三羧酸循環(huán)的過程,從而深入了解葡萄酒發(fā)酵過程中顏色變化的原因。上海鹿明生物科技有限公司多年來,一直專注于生命科學(xué)和生命技術(shù)領(lǐng)域,是國內(nèi)早期開展以蛋白組和代謝組為基礎(chǔ)的多層組學(xué)整合實驗與分析的團隊。目前鹿明生物在頂空代謝組學(xué)研究已經(jīng)有了成熟的技術(shù)方法和多項項目經(jīng)驗。北京代謝組學(xué) 定量代謝組學(xué)大起底—探究小分子物質(zhì)研究。

GC-MS非靶向代謝組學(xué)yan'j2021年11月,上海交通大學(xué)醫(yī)學(xué)院附屬新華醫(yī)院馮麗萍教授課題組在Science of the Total Environment期刊發(fā)表了題為“Transcriptomics integrated with metabolomics reveals the effect of  Bisphenol F (BPF) exposure on intestinal inflflammation ”的研究成果,通過GC-MS非靶向代謝組學(xué)和轉(zhuǎn)錄組學(xué)研究方法,發(fā)現(xiàn)了BPF暴露的腸道毒性的特征,探究了可能的發(fā)病機理。

中文標(biāo)題:轉(zhuǎn)錄組學(xué)結(jié)合代謝組學(xué)揭示了雙酚F(BPF)暴露對腸道炎癥的影響研究對象:人結(jié)腸粘膜上皮細胞系(NCM460)發(fā)表期刊:ScienceoftheTotalEnvironment影響因子:7.963發(fā)表時間:2021年11月合作單位:上海交通大學(xué)附屬新華醫(yī)院運用生物技術(shù):GC-MS非靶向代謝組學(xué)(由鹿明生物提供技術(shù)支持)、轉(zhuǎn)錄組學(xué)、qRT-PCR

非靶向和靶向代謝組學(xué)研究方法,2021年7月,廣州多家研究機構(gòu)科研人員在EuropeanRespiratoryJournal期刊發(fā)表了題為“Metabolomicanalysesrevealsnewstage-specificfeaturesoftheCOVID-19”的研究成果,該研究以****患者為研究對象,運用非靶向和靶向代謝組學(xué)研究方法,提供了****患者所有階段循環(huán)代謝物特征的綜合視圖,并確定糖代謝和尿素循環(huán)的代謝重新編程是****的潛在病理機制;提出以宿主代謝為靶點可能是在病程不同階段對抗****的一種可行的方法。代謝組學(xué)-歐易生物/鹿明生物 客戶好評 專注代謝組學(xué)研究。

非靶向代謝組學(xué)研究:利用番茄的自然變異確定番茄復(fù)合體中果實多酚的途徑結(jié)構(gòu)和代謝調(diào)控ExploitingNaturalVariationinTomatotoDefinePathwayStructureandMetabolicRegulationofFruitPolyphenolicsintheLycopersicumComplex研究對象:番茄組織發(fā)表期刊:MolecularPlant影響因子:13.164組學(xué)技術(shù):LC-MS靶向代謝組學(xué)、GC-MS非靶代謝組(雙平臺代謝組學(xué)),本研究通過表征構(gòu)成八種不同番茄多酚代謝網(wǎng)絡(luò)的潛在生物合成和修飾反應(yīng),闡明了八種番茄復(fù)合體多酚生物合成的整個生物合成框架,并對相關(guān)代謝物和結(jié)構(gòu)基因進行了詳細注釋,并運用LC-MS/GC-MS雙平臺代謝組學(xué)方法為輔助育種提供幫助。此外,番茄果實成熟過程中的代謝變化為今后基于遺傳的代謝工程設(shè)計提供了研究方向,并為研究其他重要植物物種中特定的代謝物的功能提供了理論依據(jù)。代謝組學(xué)、空間代謝組學(xué)多組學(xué)聯(lián)合分析服務(wù)。北京代謝組學(xué)功能

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代謝組學(xué)經(jīng)典研究:本篇小鹿將為各位看官推薦4篇使用代謝組學(xué)的經(jīng)典研究,***篇文章運用LC-MS/GC-MS雙平臺代謝組學(xué)探究番茄果實成熟過程中的代謝變化。第二篇文章運用16S rRNA測序+代謝組學(xué)技術(shù)研究不同分子量的PE顆粒干擾玉米生長和根際微環(huán)境的機制。第三篇文章運用GC-MS頂空代謝組學(xué)探究新等位基因系和野生型的成熟種子中發(fā)現(xiàn)了幾種不同的揮發(fā)性化合物。第四篇文章運用GC-MS非靶向代謝組學(xué)技術(shù)對對全氟辛酸(PFOA)暴露土壤栽培的黃瓜組織代謝途徑變化進行了研究。上海代謝組學(xué)的數(shù)據(jù)處理

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