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北京靶向代謝組學原理

來源: 發(fā)布時間:2022-08-15

微生物16S rRNA測序+代謝組學研究:標題:EphB6缺陷小鼠的腸道菌群通過介導維生素B6動態(tài)平衡調(diào)節(jié)孤獨癥行為期刊:MicrobiomeIF=14.650研究思路:*樣本類型:小鼠糞便、腦組織*檢測平臺:LC-MS非靶向代謝組、16S微生物多樣性檢測自閉癥譜系障礙(ASD)是一種發(fā)育障礙,目前對孤獨癥的**癥狀的有效***很有限。ASD患者臨床研究證據(jù)表明,腸道菌群與ASD發(fā)展之間存在聯(lián)系,但腸道菌群與ASD的腦功能障礙(腸腦軸)聯(lián)系機制尚未完全闡明。在腸道穩(wěn)態(tài)起著重要作用的EphB6基因(位于7q號染色體,屬于受體酪氨酸激酶Eph家族),因基因突變和在ASD患者中表達下調(diào),被認為是ASD的候選基因。但尚不清楚EphB6在調(diào)節(jié)腸道菌群和ASD發(fā)生的作用機制。本研究中作者發(fā)現(xiàn)EphB6在功能上與ASD相關,并通過腸道菌群介導的維生素B6和多巴胺,調(diào)節(jié)患者自閉癥樣行為。作者建立了EphB6缺陷小鼠腸道菌群失調(diào)與內(nèi)側(cè)前額葉皮層(mPFC)(關鍵的腸腦功能軸)的興奮/抑制失衡之間的功能聯(lián)系。3分鐘帶你看懂代謝組學研究。北京靶向代謝組學原理

代謝組學數(shù)據(jù)提供了COVID-19患者各階段循環(huán)代謝物特征的綜合觀點,并確定了葡萄糖代謝和尿素循環(huán)的代謝重編程是COVID-19的潛在病理機制。在****病程的不同階段,靶向宿主代謝可能是一種可行的方法。非靶向代謝組學分析中,發(fā)現(xiàn)隊列中的樣品共鑒定出2466個代謝物峰,負離子模式631個、正離子模式下的1835個;通過篩選,鑒定出240種代謝物。輕癥組的代謝物與正常組部分重合,而重癥組和恢復組很容易區(qū)分(圖1B)。240個代謝物中有193個與COVID-19***相關(圖1C)?;鹕綀D顯示了不同組代謝物與正常組相比上調(diào)下調(diào)的情況(圖1D);與正常組對比,***上調(diào)的代謝物:輕癥組有48個,嚴重組有59個,恢復組有64個;***下調(diào)的代謝物:輕癥組有33個,重癥組有29個,恢復組有34個。使用靶向代謝組學分析;首先根據(jù)發(fā)現(xiàn)隊列中59名受試者的血清代謝物(4個樣本因體積小而被排除);定量到了199種代謝物。根據(jù)不同組的濃度,將199個代謝物分為16個簇;然后根據(jù)恢復組的代謝物是否恢復到正常水平將這些簇分為三組。上海代謝組學結果上海 -代謝組學-提供高效檢測分析服務。

GC-MS代謝組學和 LC-MS代謝組學研究:鹽度的變化會影響甲殼類動物的生長、***和疾病狀態(tài)。文章作者通過非靶代謝組學對青蟹適應鹽度急性下降過程中的代謝變化進行了研究,利用GC-MS和LC-MS數(shù)據(jù)聯(lián)合分析了青蟹應對鹽度急性下降情況的主要代謝途徑。研究結果表明,在急性低鹽脅迫下,青蟹通過甘油磷脂代謝物調(diào)節(jié)生物膜的結構發(fā)生變化,然后通過ABCs轉(zhuǎn)運蛋白運輸氨基酸和碳水化合物,實現(xiàn)細胞內(nèi)外的滲透平衡。此項研究體現(xiàn)了組學技術在機制研究中的重要作用。王春琳課題組深耕青蟹研究,近些年來探索青蟹對環(huán)境的適應變化也在各大期刊上發(fā)表:項目文章|iTRAQ蛋白組學助力寧波大學越冬期間擬穴青蟹代謝變化研究項目文章|兩篇背靠背,王春琳、王歡課題組揭示擬穴青蟹適應鹽度驟降的代謝機理

GC-MS非靶向代謝組研究,隨著納米材料的產(chǎn)業(yè)化,各種形式的納米材料將以不同途徑進入人們的生活,納米材料的生物安全性問題正受到世界各國科學家的***關注,本篇為2020年2月,南京大學趙麗娟課題組在Environmental Science & Technology雜志發(fā)表題為“Silver Nanoparticles Alter Soil Microbial Community Compositions and Metabolite Profiles in Unplanted and Cucumber-planted Soil”的研究論文。該研究運用16S rRNA基因測序、GC-MS非靶向代謝組技術對土壤微生物組和代謝組學分析技術的獨特結合,提供了對AgNPs生態(tài)影響的全新視角,***了解了AgNPs暴露對土壤微生物的影響。代謝組學-鹿明生物-歐易生物 以生物體內(nèi)所有代謝產(chǎn)物為研究對象。

非靶向代謝組學研究:利用番茄的自然變異確定番茄復合體中果實多酚的途徑結構和代謝調(diào)控ExploitingNaturalVariationinTomatotoDefinePathwayStructureandMetabolicRegulationofFruitPolyphenolicsintheLycopersicumComplex研究對象:番茄組織發(fā)表期刊:MolecularPlant影響因子:13.164組學技術:LC-MS靶向代謝組學、GC-MS非靶代謝組(雙平臺代謝組學),本研究通過表征構成八種不同番茄多酚代謝網(wǎng)絡的潛在生物合成和修飾反應,闡明了八種番茄復合體多酚生物合成的整個生物合成框架,并對相關代謝物和結構基因進行了詳細注釋,并運用LC-MS/GC-MS雙平臺代謝組學方法為輔助育種提供幫助。此外,番茄果實成熟過程中的代謝變化為今后基于遺傳的代謝工程設計提供了研究方向,并為研究其他重要植物物種中特定的代謝物的功能提供了理論依據(jù)。代謝組學一個樣本多少錢?代謝組學可信耐服務公司。上海代謝組學結果

歐易生物助力靶向/非靶向代謝組學研究。北京靶向代謝組學原理

代謝組學研究:濃香白酒占中國白酒總產(chǎn)量的70%以上。自1960年代以來,在中國白酒釀造行業(yè)中,人工窖泥被***用于建造發(fā)酵窖以生產(chǎn)高質(zhì)量的濃香白酒。為了深入了解人工窖泥原核生物分類和功能動力學機制,以及這種變化與生產(chǎn)高質(zhì)量濃香白酒之間的聯(lián)系,本文對該釀造微生態(tài)系統(tǒng)進行了***進行了16S rRNA測序,蛋白質(zhì)組學和代謝組學聯(lián)合分析。多組學方法能夠更***地了解高質(zhì)量濃香白酒生產(chǎn)過程中人工窖泥微生物群落發(fā)生的代謝過程變化,這將有助于進一步優(yōu)化人工窖泥培養(yǎng)技術和改善濃香白酒的質(zhì)量。北京靶向代謝組學原理

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