iTRAQ標記蛋白組學研究方法：2021年12月歐易/鹿明生物合作客戶甘肅農(nóng)業(yè)大學孫萬倉教授課題組在Scientific Reports期刊發(fā)表的題為 “iTRAQ-Based Quantitative Proteome Analysis Insights into Cold Stress of Winter Turnip Rapa (Brassica rapa L.) Grown in the Field ”的研究成果，通過iTRAQ標記蛋白組學+轉(zhuǎn)錄組學研究方法，探究了莖尖分生組織的形態(tài)對冬油菜低溫耐受性中的作用。中文標題：iTRAQ標記蛋白質(zhì)組學分析揭示了低溫脅迫對田間生長冬油菜的影響研究對象：白菜型冬油菜發(fā)表期刊：ScientificReports影響因子：4.17歐易生物鹿明生物蛋白組學聯(lián)合分析。上海外泌體蛋白組學檢測
作者使用通過單細胞蛋白組學產(chǎn)生的數(shù)據(jù)來觀察在腎小球細胞或近端腎小管中***豐富的蛋白質(zhì)細胞。208個Glom富集區(qū)蛋白富含囊泡中間運輸和細胞成分組織調(diào)節(jié)作為其**重要的生物學過程，細胞骨架蛋白結(jié)合和肌動蛋白結(jié)合是**重要的分子功能，肌動蛋白細胞骨架是**豐富的細胞成分。富含247個PT的蛋白質(zhì)主要集中在小分子代謝過程和藥物代謝過程中。在**重要的分子功能中，這些蛋白質(zhì)的氧化還原酶活性和催化活性豐富。*在GLOM切片中發(fā)現(xiàn)的67種蛋白質(zhì)中，有41種已被報導存在于腎臟中，在這41種蛋白質(zhì)中，18種(43.9%)與單細胞蛋白組學結(jié)果一致，23種(56.1%)在GLOM中與小管相比沒有增加。北京蛋白組學 價格歐易鹿明生物基于質(zhì)譜技術(shù),生物信息學方法,提供蛋白質(zhì)組學。
在本研究中，利用iTRAQ標記定量蛋白組學方法對東京野茉莉種子發(fā)育的4個時間點采樣進行蛋白質(zhì)組學分析。獲得了2338個蛋白和1473個DEPs。Mfuzz聚類分析顯示，在種子發(fā)育過程中，轉(zhuǎn)錄本和蛋白質(zhì)組之間存在相當大的時序一致性。在四個發(fā)育時期中，花后70天（種子發(fā)育活躍期）是視為東京野茉莉種仁發(fā)育的關鍵時期：在該階段與脂肪酸生物合成相關的功能基因和酶蛋白均達到表達峰值，同時種仁內(nèi)部大部分營養(yǎng)物質(zhì)開始迅速積累。通過轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)和蛋白質(zhì)組數(shù)據(jù)綜合分析油脂合成的調(diào)控網(wǎng)絡，乙酰CoA羧化酶和**酸脫氫酶兩個酶體系處于中心位置，在脂肪酸的合成過程中具有主導作用。
2021年10月，中國科學院上海營養(yǎng)與健康研究所武愛波研究員課題組在《Ecotoxicology and Environmental Safety》（IF:6.291）發(fā)表了題為“Mycotoxin deoxynivalenol affects myoblast differentiation via downregulating cytoskeleton and ECM-integrin-FAK-RAC-PAK signaling pathway"的研究成果，通過轉(zhuǎn)錄組學和蛋白質(zhì)組學研究方法，探究了脫氧雪腐鐮刀菌烯醇（簡稱：DON，俗稱嘔吐***）對成肌細胞分化的影響，發(fā)現(xiàn)了DON處理使得細胞骨架蛋白和細胞外基質(zhì)蛋白表達下調(diào)，并抑制ECM-integrin-FAK-RAC-PAK信號通路的機理，為食品和飼料污染的防治提供了理論依據(jù)。其中轉(zhuǎn)錄組學和蛋白組學由歐易/鹿明生物提供技術(shù)支持。定量蛋白質(zhì)組學 蛋白質(zhì)進行質(zhì)譜檢測未知蛋白進行全檢測。
綜上所述，本研究應用RNA-seq轉(zhuǎn)錄組分析結(jié)合iTRAQ蛋白質(zhì)組學技術(shù)，探討油茶種子不同成熟期儲量積累的動態(tài)變化。此外，作者還探討了黃酮類化合物和脂肪酸的生物合成和代謝可能的調(diào)控機制。許多功能轉(zhuǎn)錄本(16530)和蛋白質(zhì)物種(1228)的模式發(fā)生了***變化，其中317個DAPs被轉(zhuǎn)錄組結(jié)果覆蓋。結(jié)合結(jié)構(gòu)基因(蛋白)或轉(zhuǎn)錄因子的表達譜及相應化合物的含量，對重要代謝產(chǎn)物的調(diào)控網(wǎng)絡進行了探討。結(jié)果表明，黃酮類化合物的合成能力在種子成熟過程中逐漸減弱，而脂肪酸的合成能力則先升高后下降。蛋白質(zhì)組學 找歐易生物-生物標志物、機制研究一站式服務。北京乳蛋白組學
蛋白組學方案為組學研究涉及的樣本獲取,前處理,數(shù)據(jù)采集到分析的各個環(huán)節(jié)提供自動化。上海外泌體蛋白組學檢測
為了驗證TMT蛋白組學數(shù)據(jù)，作者選擇了18個與蓮種胚脫水保護功能密切相關的候選DEPs進行PRM蛋白靶向驗證。PRM鑒定了18個候選DEPs。這些蛋白質(zhì)的表達模式在PRM和TMT的定量結(jié)果之間顯示出類似的趨勢。然而，PRM檢測到的蛋白豐度的倍數(shù)變化值要大于TMT數(shù)據(jù)。這一結(jié)果在很大程度上支持了TMT數(shù)據(jù)的可靠性。基于TMT標記定量蛋白質(zhì)組學的生物信息學分析，對脅迫生理指標進行了測定，以驗證蓮種胚脫水的保護機制。在快速脫水階段，REC和MDA含量的變化與RWC相反，它們的水平迅速增加（圖6A，B）。ABA含量在快速脫水和脫水成熟階段前略有增加（圖6C）。上上海外泌體蛋白組學檢測
上海歐易生物醫(yī)學科技有限公司致力于醫(yī)藥健康，以科技創(chuàng)新實現(xiàn)高質(zhì)量管理的追求。歐易生物深耕行業(yè)多年，始終以客戶的需求為向?qū)В瑸榭蛻籼峁└哔|(zhì)量的科研服務，科研檢測，學術(shù)研究，技術(shù)咨詢。歐易生物不斷開拓創(chuàng)新，追求出色，以技術(shù)為先導，以產(chǎn)品為平臺，以應用為重點，以服務為保證，不斷為客戶創(chuàng)造更高價值，提供更優(yōu)服務。歐易生物始終關注自身，在風云變化的時代，對自身的建設毫不懈怠，高度的專注與執(zhí)著使歐易生物在行業(yè)的從容而自信。