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江蘇蛋白組學服務公司

來源: 發(fā)布時間:2022-09-21

采用RNA-Seq轉(zhuǎn)錄組學分析和DIA蛋白質(zhì)組學分析,研究了AC和AL對db/db小鼠的影響。轉(zhuǎn)錄組分析共鑒定出16812種不同的蛋白質(zhì)編碼轉(zhuǎn)錄本。其中,2837個(約16.9%)在正常組和對照組之間有***差異,表明db/db小鼠在轉(zhuǎn)錄水平上與野生型小鼠***不同。與對照組相比,共有3749個基因因攝入AC而發(fā)生***改變(2201個下調(diào),1548個上調(diào)),560個基因(430個下調(diào),130個上調(diào))因攝入AL而發(fā)生***改變(圖3B)。DIA蛋白質(zhì)組學分析鑒定出2729種蛋白質(zhì)。正常組和對照組之間共發(fā)現(xiàn)1059個(約占總鑒定蛋白質(zhì)的38.8%)DEPs,AC處理有230個蛋白質(zhì)發(fā)生***變化(109個上調(diào),121個下調(diào)),AL處理有211個蛋白質(zhì)發(fā)生***變化(116個上調(diào),95個下調(diào))。蛋白質(zhì)組學質(zhì)譜分析蛋白質(zhì)組學三大基本技術。江蘇蛋白組學服務公司

TMTpro-16plex等標記試劑已經(jīng)發(fā)布一年,廣受科研工作者喜愛。但是,對于6組3重復、3組6重復的實驗設計,16plex卻難以滿足。TMTpro? 18-plex標記蛋白組會是更好的選擇方式。其中基于質(zhì)譜儀平臺的蛋白組學近年來備受青睞,穩(wěn)定同位素標記策略也被廣泛應用于多重定量蛋白質(zhì)組學中。鹿明生物推出Thermo Scientific? TMTpro? 18-plex標記蛋白組,18個樣本以內(nèi),可實現(xiàn)一次標記和分級,避免了多批次標記引入的批次效應,能***提升樣本的數(shù)據(jù)質(zhì)量。同時對更多蛋白質(zhì)鑒定和定量,提供了樣本的多通路處理水平。這個技術可謂是2021年的又一創(chuàng)新技術。浙江蛋白組學的結(jié)果怎么分析歐易生物鹿明生物蛋白組學聯(lián)合分析。

作者通過泛素化蛋白組學分析鑒定了茶樹作根中的泛素化蛋白質(zhì)。中文標題:氮調(diào)節(jié)茶樹根中茶氨酸和黃酮類化合物的生物合成:多組學分析揭示的蛋白質(zhì)水平調(diào)節(jié)研究對象:茶樹根發(fā)表期刊:JournalofAgriculturalandFoodChemistry影響因子:5.279發(fā)表時間:2021年9月1日發(fā)表單位:安徽農(nóng)業(yè)大學運用生物技術:TMT蛋白質(zhì)組學、泛素化蛋白質(zhì)組學(其中部分數(shù)據(jù)分析由鹿明生物提供技術支持)。本文分析了氮缺乏下茶樹根部的茶氨酸和黃酮類代謝,通過蛋白質(zhì)組和泛素化蛋白質(zhì)組結(jié)合轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)探索了調(diào)節(jié)機制。本文的多組學數(shù)據(jù)整合分析思路值得借鑒。

作者使用通過單細胞蛋白組學產(chǎn)生的數(shù)據(jù)來觀察在腎小球細胞或近端腎小管中***豐富的蛋白質(zhì)細胞。208個Glom富集區(qū)蛋白富含囊泡中間運輸和細胞成分組織調(diào)節(jié)作為其**重要的生物學過程,細胞骨架蛋白結(jié)合和肌動蛋白結(jié)合是**重要的分子功能,肌動蛋白細胞骨架是**豐富的細胞成分。富含247個PT的蛋白質(zhì)主要集中在小分子代謝過程和藥物代謝過程中。在**重要的分子功能中,這些蛋白質(zhì)的氧化還原酶活性和催化活性豐富。*在GLOM切片中發(fā)現(xiàn)的67種蛋白質(zhì)中,有41種已被報導存在于腎臟中,在這41種蛋白質(zhì)中,18種(43.9%)與單細胞蛋白組學結(jié)果一致,23種(56.1%)在GLOM中與小管相比沒有增加。TMT/iTRAQ標記定量蛋白組學 差異表達蛋白質(zhì)組分析研究。

作者運用iTRAQ標記定量蛋白組學對種子發(fā)育過程中蛋白質(zhì)表達的定量比較,同時進行GO和KEGG通路富集分析。結(jié)果表明所有鑒定的蛋白被分為29類,主要涉及翻譯和碳水化合物代謝。并且作者繪制了p值小于0.01的前20條KEGG通路的氣泡圖。在三對比較中,普遍富集的途徑包括脂肪酸降解、苯丙素生物合成和脂肪酸代謝。其中,參與α-亞麻酸代謝的DAPs在S3 vs. S1組和S4 vs. S1組中都非?;钴S。為了評估轉(zhuǎn)錄組和蛋白質(zhì)組之間的一致性,以及了解轉(zhuǎn)錄后的mRNA在蛋白質(zhì)水平上是如何表現(xiàn)的,作者進行了RNA-seq和iTRAQ分析的聯(lián)合分析。證明DEGs和DAPs參與類黃酮的生物合成和脂肪酸代謝。定量蛋白質(zhì)組學 蛋白質(zhì)進行質(zhì)譜檢測未知蛋白進行全檢測。江西藥物的蛋白組學

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蛋白組學研究案例:2022年1月,歐易/鹿明生物合作客戶北京中醫(yī)藥大學教育部中醫(yī)養(yǎng)生學重點實驗室劉銅華教授課題組在Frontiers in Nutrition期刊發(fā)表了題為 “Mechanisms for Improving Hepatic Glucolipid Metabolism by Cinnamic Acid and Cinnamic Aldehyde: An Insight Provided by Multi-Omics ”的研究成果,通過轉(zhuǎn)錄組學和蛋白質(zhì)組學研究方法,發(fā)現(xiàn)了肉桂酸(AC)和肉桂醛(AL)在改善葡萄糖脂代謝中的特征,探究了其代謝作用機理。為預防和***代謝紊亂等疾病提供了理論依據(jù)。江蘇蛋白組學服務公司

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