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山東分子蛋白組學(xué)

來源: 發(fā)布時(shí)間:2022-09-27

作者通過泛素化蛋白組學(xué)分析鑒定了茶樹作根中的泛素化蛋白質(zhì)。中文標(biāo)題:氮調(diào)節(jié)茶樹根中茶氨酸和黃酮類化合物的生物合成:多組學(xué)分析揭示的蛋白質(zhì)水平調(diào)節(jié)研究對(duì)象:茶樹根發(fā)表期刊:JournalofAgriculturalandFoodChemistry影響因子:5.279發(fā)表時(shí)間:2021年9月1日發(fā)表單位:安徽農(nóng)業(yè)大學(xué)運(yùn)用生物技術(shù):TMT蛋白質(zhì)組學(xué)、泛素化蛋白質(zhì)組學(xué)(其中部分?jǐn)?shù)據(jù)分析由鹿明生物提供技術(shù)支持)。本文分析了氮缺乏下茶樹根部的茶氨酸和黃酮類代謝,通過蛋白質(zhì)組和泛素化蛋白質(zhì)組結(jié)合轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)探索了調(diào)節(jié)機(jī)制。本文的多組學(xué)數(shù)據(jù)整合分析思路值得借鑒。單細(xì)胞蛋白組學(xué)之質(zhì)譜流式細(xì)胞技術(shù)。山東分子蛋白組學(xué)

4D蛋白組學(xué):tims TOF Pro2依賴于雙捕集離子淌度(TIMS)和同步累積連續(xù)碎裂(PASEF)數(shù)據(jù)采集模式兩大創(chuàng)新技術(shù),可實(shí)現(xiàn)快速采集、更高的靈敏度和特異性。同時(shí),其配備了***一代雙 TIMS 分析器,離子容量可提高三倍,比較大限度地提高了離子傳輸效率和靈敏度,讓蛋白質(zhì)組學(xué)分析再上一個(gè)新的臺(tái)階,鹿明生物同時(shí)配備了Evosep One高通量色譜使其在短梯度下也能實(shí)現(xiàn)蛋白深度覆蓋,結(jié)果更精細(xì),也成為轉(zhuǎn)化組學(xué)應(yīng)用不可或缺的工具。更高掃描速度:助力臨床大隊(duì)列項(xiàng)目研究,更高覆蓋深度:助力蛋白組鑒定到更多的蛋白數(shù)量,超高靈敏度:助力微量樣本蛋白組分析,鑒定更可信:助力蛋白或化合物更高可信度的鑒定。內(nèi)蒙古蛋白組學(xué)非標(biāo)記定量質(zhì)譜技術(shù),生物信息學(xué)方法,提供蛋白質(zhì)組學(xué) 。

蛋白質(zhì)組學(xué)(由鹿明生物提供技術(shù)支持);2021年8月,中國醫(yī)學(xué)科學(xué)院基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)研究所趙春華和韓欽課題組在Aging and disease期刊發(fā)表了題為“MSC-derived Exosomes can Enhance the Angiogenesis of Human Brain MECs and show Therapeutic Potential in a Mouse Model of Parkinson's Disease”的研究成果,通過蛋白質(zhì)組學(xué)研究方法,發(fā)現(xiàn)了間充質(zhì)干細(xì)胞衍生的外泌體可以通過增加ICAM1的表達(dá)來促人腦MECs血管生成,并減輕MPP+對(duì)細(xì)胞的損傷,***間充質(zhì)干細(xì)胞衍生外泌體***帕金森的可能性。

采用RNA-Seq轉(zhuǎn)錄組學(xué)分析和DIA蛋白質(zhì)組學(xué)分析,研究了AC和AL對(duì)db/db小鼠的影響。轉(zhuǎn)錄組分析共鑒定出16812種不同的蛋白質(zhì)編碼轉(zhuǎn)錄本。其中,2837個(gè)(約16.9%)在正常組和對(duì)照組之間有***差異,表明db/db小鼠在轉(zhuǎn)錄水平上與野生型小鼠***不同。與對(duì)照組相比,共有3749個(gè)基因因攝入AC而發(fā)生***改變(2201個(gè)下調(diào),1548個(gè)上調(diào)),560個(gè)基因(430個(gè)下調(diào),130個(gè)上調(diào))因攝入AL而發(fā)生***改變(圖3B)。DIA蛋白質(zhì)組學(xué)分析鑒定出2729種蛋白質(zhì)。正常組和對(duì)照組之間共發(fā)現(xiàn)1059個(gè)(約占總鑒定蛋白質(zhì)的38.8%)DEPs,AC處理有230個(gè)蛋白質(zhì)發(fā)生***變化(109個(gè)上調(diào),121個(gè)下調(diào)),AL處理有211個(gè)蛋白質(zhì)發(fā)生***變化(116個(gè)上調(diào),95個(gè)下調(diào))。蛋白組學(xué)檢測一個(gè)樣多少錢。

隨著美國臨床蛋白質(zhì)組**分析項(xiàng)目(CPTAC)和中國人類蛋白質(zhì)組計(jì)劃(CNHPP)等大型蛋白質(zhì)組學(xué)研究計(jì)劃的推進(jìn),發(fā)表了一系列**的大規(guī)模人群多組學(xué)分析文章[2,3]。這些高分文章通過基因組學(xué)、轉(zhuǎn)錄組學(xué)、蛋白質(zhì)組學(xué)、磷酸化蛋白質(zhì)組學(xué)、代謝組學(xué)、微生物組學(xué)等技術(shù),在上百例的病例樣本中***表征了某種**的分子特征。對(duì)比這些文章,可以發(fā)現(xiàn)蛋白質(zhì)組學(xué)數(shù)據(jù)在多組學(xué)數(shù)據(jù)分析中逐漸成為**結(jié)果,且蛋白質(zhì)組學(xué)數(shù)據(jù)分析有些共同特點(diǎn),即:1)基于蛋白質(zhì)組進(jìn)行**分子分型2)分析不同亞型患者的臨床特征3)免疫、代謝、突變、微生物等**領(lǐng)域研究熱點(diǎn)在不同亞型中的差別分析4)篩選亞型特征分子作為預(yù)后標(biāo)志物或潛在的藥靶進(jìn)行驗(yàn)證或機(jī)制研究該文是樊嘉院士/周虎研究員/高大明研究員/**教授團(tuán)隊(duì)繼2019年Cell發(fā)表的肝細(xì)胞*多組學(xué)研究后,同樣基于蛋白質(zhì)組為**的多組學(xué)聯(lián)合分析策略,進(jìn)一步闡釋了蛋白質(zhì)組學(xué)驅(qū)動(dòng)精細(xì)醫(yī)學(xué)的優(yōu)勢,為**的發(fā)***展機(jī)制、分子分型、預(yù)后監(jiān)測和個(gè)性化***策略提供新思路。蛋白組學(xué)問題解答知乎都做不到哦。山東蛋白組學(xué)研究雜志

蛋白組學(xué)研究必看的經(jīng)典綜述。山東分子蛋白組學(xué)

為了更好地了解DON對(duì)C2C12細(xì)胞分化的影響,作者進(jìn)行了轉(zhuǎn)錄組學(xué)和蛋白質(zhì)組學(xué)的整合分析。共鑒定了149個(gè)共同的***差異基因(co-DEG),其中91%被共下調(diào)(圖3A)。15%的co-DEG屬于真核細(xì)胞骨架,其中大部分屬于肌動(dòng)蛋白絲,少數(shù)是中間絲和微管的成分。對(duì)co-DEG進(jìn)行GO分析,生物學(xué)過程富集了“骨骼肌肌球蛋白粗絲組裝”和“快肌纖維收縮的正向調(diào)節(jié)”條目。細(xì)胞組分中富集的**個(gè)條目是“纖維蛋白原復(fù)合物”、“細(xì)胞外空間”、“細(xì)胞外基質(zhì)”、“細(xì)胞外區(qū)域”和“蛋白質(zhì)細(xì)胞外基質(zhì)”,這些都是細(xì)胞外成分(圖3B)。結(jié)果表明,DON主要影響肌肉成分的組成和功能以及多種細(xì)胞外成分的表達(dá)。通路富集分析富集到了“ECM-受體相互作用”、“蛋白質(zhì)消化和吸收”、“人**瘤病毒***”和“粘著斑”等通路。山東分子蛋白組學(xué)

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