空間轉(zhuǎn)錄組技術(shù)作為當今前沿的科研技術(shù)，相信很多老師都希望將其運用于自己的課題中，快速發(fā)表高分文章。歐易生物具有上百例空間轉(zhuǎn)錄組項目執(zhí)行經(jīng)驗，致力通過質(zhì)量的服務，助力各位科研工作者取得新的突破。由上海歐易生物醫(yī)學科技有限公司（以下簡稱“歐易生物”）主辦的“空間轉(zhuǎn)錄組學培訓班”落下帷幕。培訓中，歐易講師團隊以其豐富的項目經(jīng)驗及專業(yè)的生信能力，從空間轉(zhuǎn)錄組學的發(fā)展歷程、測序原理、實驗實操及數(shù)據(jù)挖掘等多維度，向遠道而來的學員們展開了系統(tǒng)性的培訓。
通過空間轉(zhuǎn)錄組技術(shù)可獲取組織中具體的位置轉(zhuǎn)錄信息，為研究和診斷提供有效數(shù)據(jù)支撐。四川歐易生物空間轉(zhuǎn)錄組使用
美國腦計劃啟動的 BICCN 項目，該項目將整合不同類型細胞的分子、解剖學和生理學特性，創(chuàng)建小鼠腦細胞 3D 參考圖譜，同時也將基于人類和非人類靈長類腦組織樣本，繪制腦細胞參考圖譜 ，其涉及空間轉(zhuǎn)錄組學技術(shù)主要包括 MERFISH 和 seqFISH。一些實現(xiàn)空間轉(zhuǎn)錄組學的重要技術(shù)，可以追溯到二十世紀七十年代，長期以來，各種形式的原位雜交技術(shù)（ISH）已用于可視化空間中的基因表達。從技術(shù)原理中不難看出，空間轉(zhuǎn)錄組技術(shù)重要為特殊的載玻片。山西空間轉(zhuǎn)錄組規(guī)格空間轉(zhuǎn)錄組學技術(shù)主要包括 MERFISH 和 seqFISH。
轉(zhuǎn)錄本的空間位置信息可以通過在原位陣列上捕獲的組織切片中的轉(zhuǎn)錄本來獲取，目前已有多種技術(shù)策略被開發(fā)報道， 如空間轉(zhuǎn)錄組技術(shù)（Spatial Transcriptomics，ST）和 Visium 技術(shù)，通過將包含空間位置信息的條形碼、UMI 標簽、poly-dT 的探針固定在商用微陣列載玻片上，來捕獲包含 poly(A) 尾巴的轉(zhuǎn)錄本，并獲取全轉(zhuǎn)錄組水平的基因表達及位置信息。一些無需成像即可計算重建空間基因表達模式所需信息的技術(shù)也被開發(fā)了出來，其中之一就是是 DNA 顯微技術(shù)，它記錄 cDNA 之間的接近度，該信息可用于重建轉(zhuǎn)錄本之間的相對位置。
Visium空間轉(zhuǎn)錄組能夠做何種組織類型以及推薦切片厚度是什么？10X Genomics測試過很多組織類型，絕大多數(shù)都可以用于空間轉(zhuǎn)錄組的分析。下圖是他們官網(wǎng)上測試過的組織類型的列表，測試過的組織都可以運用在空間轉(zhuǎn)錄組的分析上面。但建議用戶用基因表達玻片做正式實驗前，務必用組織優(yōu)化的玻片測試一下，看組織能否用于空間轉(zhuǎn)錄組的實驗，同時也找到比較好的組織通透時間。切片厚度基本上以10μm為主，但也有少量組織例外。歐易生物具有上百例空間轉(zhuǎn)錄組項目執(zhí)行經(jīng)驗，致力通過質(zhì)量的服務，助力各位科研工作者取得新的突破。10x Genomics空間轉(zhuǎn)錄組技術(shù)可以應用于免疫、發(fā)育、神經(jīng)和病理等研究方向。
單細胞轉(zhuǎn)錄組測序技術(shù)的如火如荼，伴隨著空間轉(zhuǎn)錄組測序技術(shù)的蓬勃發(fā)展，可以看到，在現(xiàn)有的高通量檢測技術(shù)領域，這兩種技術(shù)已為科學研究的發(fā)展提供了前所未有的技術(shù)支撐。從2019年單細胞多組學被評為《Nature Methods》年度技術(shù)進展，到2020年空間轉(zhuǎn)錄組技術(shù)也被評為年度技術(shù)進展，相信在接下來的時間里，單細胞轉(zhuǎn)錄組和空間轉(zhuǎn)錄組將為生命科學的發(fā)展做出極其重要的貢獻。單細胞轉(zhuǎn)錄組測序技術(shù)的特點在于提供詳實的每個細胞的轉(zhuǎn)錄表達信息，但是缺失了來源組織的空間組成信息?，F(xiàn)有商用空間轉(zhuǎn)錄組測序技術(shù)的特點在于提供了完整的組織空間位置信息，但是每個捕獲spot的信息無法達到單細胞分辨率（10個左右細胞）。因此，這兩個技術(shù)的存在是天然互補的，而將兩者的結(jié)合也是水到渠成，完美結(jié)合?？臻g轉(zhuǎn)錄組的組學板塊包括cDNA的合成、擴增、接頭連接和測序，記錄切片的轉(zhuǎn)錄本信息和空間位置信息 。安徽空間轉(zhuǎn)錄組質(zhì)量
空間轉(zhuǎn)錄組可以進行細胞間通訊分析，區(qū)別在于空間位置信息可以同時用于識別潛在的細胞間相互作用。四川歐易生物空間轉(zhuǎn)錄組使用
空間基因表達技術(shù)能夠在保留空間背景信息的同時，多角度測量轉(zhuǎn)錄組譜。然而，現(xiàn)有的分析方法并沒有解決技術(shù)分辨率有限或有效利用空間信息的問題。來自美國的科研團隊開發(fā)了BayesSpace，這是一種完全貝葉斯統(tǒng)計方法，它使用來自空間鄰域的信息來增強空間轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)的分辨率并進行聚類分析?；鶞蕼y試證明BayesSpace在識別具有相似表達譜的空間簇和提高空間轉(zhuǎn)錄組學分辨率方面的效用，其既克服了有效利用空間信息進行表達數(shù)據(jù)聚類的挑戰(zhàn)，又克服了目前空間轉(zhuǎn)錄組技術(shù)分辨率有限的問題。四川歐易生物空間轉(zhuǎn)錄組使用
上海歐易生物醫(yī)學科技有限公司是一家檢驗檢測服務。（依法須經(jīng)批準的項目，經(jīng)相關(guān)部門批準后方可開展經(jīng)營活動，具體經(jīng)營項目以相關(guān)部門批準文件或許可證件為準）一般項目：生物醫(yī)藥產(chǎn)品、生化產(chǎn)品的研發(fā)，醫(yī)藥中間體、化工原料及產(chǎn)品（除危險品化學品、監(jiān)控化學品、易制毒化學品）的研發(fā)、銷售，儀器儀表的銷售，并提供相關(guān)技術(shù)咨詢、技術(shù)服務，會務服務，企業(yè)管理咨詢。的公司，致力于發(fā)展為創(chuàng)新務實、誠實可信的企業(yè)。歐易生物深耕行業(yè)多年，始終以客戶的需求為向?qū)?，為客戶提供高品質(zhì)的科研服務，科研檢測，學術(shù)研究，技術(shù)咨詢。歐易生物始終以本分踏實的精神和必勝的信念，影響并帶動團隊取得成功。歐易生物始終關(guān)注醫(yī)藥健康行業(yè)。滿足市場需求，提高產(chǎn)品價值，是我們前行的力量。