T7EndonucleaseI(T7EI)在CRISPR/Cas9基因編輯中的應(yīng)用主要體現(xiàn)在突變體檢測(cè)和基因編輯效率評(píng)估上。以下是T7EI在CRISPR/Cas9中的具體應(yīng)用步驟和特點(diǎn)：1.**基因編輯效率評(píng)估**：-T7EI用于評(píng)估CRISPR-Cas9在給定的導(dǎo)向RNA靶位點(diǎn)上對(duì)細(xì)胞群體進(jìn)行基因編輯的效率。-通過(guò)PCR擴(kuò)增圍繞CRISPR導(dǎo)向RNA靶位點(diǎn)的基因組DNA，如果CRISPR-Cas9介導(dǎo)的非同源末端連接（NHEJ）修復(fù)事件引入了突變，變性和退火將形成突變型和野生型PCR擴(kuò)增子的異源雙鏈DNA。2.**突變體檢測(cè)**：-如果CRISPR/Cas9編輯成功在DNA上引入突變，則可與野生型DNA片段退火產(chǎn)生異質(zhì)雙鏈DNA。T7EI可以識(shí)別該DNA上的不完全配對(duì)的DNA位點(diǎn)然后進(jìn)行雙鏈切割，通過(guò)瓊脂糖凝膠電泳即可顯示酶切后的條帶，從而半定量判定基因編輯效果。-T7EI能識(shí)別長(zhǎng)度大于或等于2bp的插入、缺失或突變導(dǎo)致的錯(cuò)配DNA，不能識(shí)別1bp的插入、缺失或突變。3.**實(shí)驗(yàn)步驟**：-收集細(xì)胞并提取基因組DNA，然后使用PCR擴(kuò)增期望編輯的基因組區(qū)域。擴(kuò)增子的長(zhǎng)度建議為0.5-1kb。-對(duì)擴(kuò)增的DNA進(jìn)行變性和退火復(fù)性，以產(chǎn)生異質(zhì)雙鏈DNA。-使用T7EI酶處理退火后的DNA產(chǎn)物，在37℃孵育15分鐘。

牛痘DNA拓?fù)洚悩?gòu)酶I（VacciniaVirusDNATopoisomeraseI）在實(shí)驗(yàn)室中的使用主要涉及以下幾個(gè)步驟：1.**DNA載體連接**：-牛痘DNA拓?fù)洚悩?gòu)酶I可以用于DNA載體連接，特別是在TOPO克隆載體制備中。它能夠識(shí)別并切割雙鏈DNA末端[5’C(T)CCTT]，并與DNA形成共價(jià)連接形成穩(wěn)定復(fù)合物，遇到DNA的5’-OH基團(tuán)后，重新連接形成完整DNA鏈。2.**接頭連接**：-在NGS建庫(kù)中，牛痘DNA拓?fù)洚悩?gòu)酶I可用于接頭連接。這包括將含有特定序列的接頭A和接頭B與酶一起孵育，以實(shí)現(xiàn)DNA片段的連接。3.**操作步驟**：-**質(zhì)粒解旋**：將超螺旋質(zhì)粒DNA與牛痘DNA拓?fù)洚悩?gòu)酶I混合，在37°C下孵育5-15分鐘，以實(shí)現(xiàn)質(zhì)粒的解旋。-**接頭連接**：將接頭A（含CCCTT序列）和接頭B（含5’OH）與牛痘DNA拓?fù)洚悩?gòu)酶I混合，在37°C下孵育5-15分鐘，以實(shí)現(xiàn)接頭的連接。4.**注意事項(xiàng)**：-雙鏈接頭A通常5’端做NH2封閉修飾，以防止自連接；接頭A的CCCTT后通常包含5-12bp尾巴，再長(zhǎng)的尾巴會(huì)導(dǎo)致連接效率大幅下降。-雙鏈接頭B的5’端必須包含-OH。-由于該酶應(yīng)用廣，在不同的實(shí)驗(yàn)中使用策略不同，需要靈活運(yùn)用，并根據(jù)具體文獻(xiàn)進(jìn)行調(diào)整。

Recombinant Cynomolgus BDCA-2 Protein,mFc TagCRISPR/Cas12a 是一種單一的RNA引導(dǎo)的核酸內(nèi)切酶，通過(guò)CRISPR/Cas9系統(tǒng)為靶向基因組工程提供了新的機(jī)會(huì)。

在質(zhì)粒DNA提取過(guò)程中，確保DNA的完整性和活性至關(guān)重要，這通常涉及以下幾個(gè)關(guān)鍵因素：1.**溫和的裂解條件**：選擇適當(dāng)?shù)牧呀夥椒▽?duì)于保持DNA的完整性至關(guān)重要。對(duì)于大于15kb的質(zhì)粒DNA，應(yīng)采用溫和的裂解方法，如將細(xì)菌懸浮于等滲的葡萄糖溶液中，加入溶菌酶和EDTA破壞細(xì)胞壁和細(xì)胞膜，以減少對(duì)質(zhì)粒DNA的機(jī)械剪切力，從而保護(hù)其完整性。2.**避免過(guò)度裂解**：在質(zhì)粒提取過(guò)程中，并非裂解時(shí)間越長(zhǎng)越好。過(guò)長(zhǎng)的裂解時(shí)間可能會(huì)造成基因組DNA片段的污染，影響質(zhì)粒的純度。3.**適當(dāng)?shù)南礈旌拖疵?*：在純化過(guò)程中，適當(dāng)?shù)南礈炜梢匀コ鞍踪|(zhì)和其他雜質(zhì)，但過(guò)度洗滌可能會(huì)導(dǎo)致DNA的損失。洗脫步驟中，確保洗脫液完全浸潤(rùn)柱膜，以保證結(jié)合在柱膜上的質(zhì)粒得以充分洗脫，避免因洗脫體積過(guò)小而影響質(zhì)粒得率。4.**避免DNA的降解**：在提取過(guò)程中，添加核酸酶抑制劑可以防止DNA被核酸酶降解。同時(shí)，避免長(zhǎng)時(shí)間將DNA暴露在室溫下，以及避免多次凍融循環(huán)，這些都有助于保護(hù)DNA的完整性。5.**低溫操作**：盡量在低溫條件下進(jìn)行提取操作，以減少核酸酶的活性，從而保護(hù)DNA的完整性。

牛痘DNA拓?fù)洚悩?gòu)酶I（VacciniaVirusDNATopoisomeraseI）是一種來(lái)源于牛痘病毒的I型真核拓?fù)洚悩?gòu)酶，具有以下功能和應(yīng)用：1.**功能**：-牛痘DNA拓?fù)洚悩?gòu)酶I可以催化雙鏈DNA分子中單鏈DNA特定序列位置的磷酸二酯鍵的斷開(kāi)和連接。-具有解超螺旋的酶(DNARelaxingEnzyme)活性，能夠通過(guò)快速的酶切和連接使雙鏈共價(jià)閉合環(huán)狀的正或負(fù)超螺旋DNA發(fā)生解超螺旋，形成含有較少的正或負(fù)超螺旋的雙鏈環(huán)狀DNA分子。-能夠使雙鏈DNA形成繩結(jié)(knotting)或解開(kāi)繩結(jié)(unknotting)，聯(lián)結(jié)互補(bǔ)的單鏈環(huán)狀DNA成為雙鏈環(huán)狀DNA。2.**應(yīng)用**：-作為一種DNA重組連接的新型工具酶，用于DNA載體和重組片段的連接、缺刻修復(fù)、接頭連接等。-適用于TOPO克隆載體的制備、NGS建庫(kù)中的接頭連接等。-在TOPO克隆技術(shù)中，DNA拓?fù)洚悩?gòu)酶I同時(shí)具有限制酶和連接酶特性，其生物學(xué)功能是在復(fù)制期間切割并重新連接DNA。3.**使用方法**：-用于DNA快速酶切流程，包括配制體系反應(yīng)液、輕柔混勻、37℃孵育15分鐘等步驟。4.**儲(chǔ)存條件**：-建議在-25～-15℃保存，有效期為3年。5.**注意事項(xiàng)**：-避免起泡或劇烈攪拌、渦旋等操作，以防止酶失活。牛痘DNA拓?fù)洚悩?gòu)酶I因其獨(dú)特的功能，在分子生物學(xué)研究和基因工程中扮演著重要的角色。FnCas12a在完成特異性切割后，還能非特異性地切割其他單鏈DNA，這一特性被用于開(kāi)發(fā)了多種核酸檢測(cè)技術(shù)。

CUT&RUN和ChIC是兩種用于研究蛋白質(zhì)-DNA相互作用的技術(shù)，它們有一些關(guān)鍵的區(qū)別：1.**技術(shù)原理**：-**ChIC（ChromatinImmunocleavage）**：ChIC技術(shù)利用抗體將感興趣的蛋白與ProteinA-MNase相結(jié)合來(lái)進(jìn)行DNA切割。ChIC的優(yōu)勢(shì)在于使用TF特異性抗體系住MNase，并只在結(jié)合位點(diǎn)裂解。-**CUT&RUN（CleavageUnderTargetsandReleaseUsingNuclease）**：CUT&RUN技術(shù)則是在核的輕微MNase處理后釋放單核小體和TF-DNA復(fù)合物，留下寡核小體。CUT&RUN通過(guò)在冰上進(jìn)行簡(jiǎn)短的消化反應(yīng)，在TF結(jié)合的MNase擴(kuò)散到周邊的基因組和裂解可接近的染色質(zhì)之前在上清中恢復(fù)TF-DNA復(fù)合物。2.**操作步驟和簡(jiǎn)便性**：-**ChIC**：ChIC可能需要甲醛固定操作，這可能重新引入了ChIP-seq的一些問(wèn)題，如交聯(lián)導(dǎo)致的DNA和蛋白質(zhì)的化學(xué)修飾。-**CUT&RUN**：CUT&RUN簡(jiǎn)化了操作步驟，使用磁珠固定細(xì)胞核，適用于新鮮和冷凍組織樣本，縮短了生成DNA測(cè)序文庫(kù)的時(shí)間（1-2天）。3.**背景信號(hào)和信噪比**：-**ChIC**：ChIC產(chǎn)生的背景信號(hào)可能較高，因?yàn)樗赡苌婕暗椒翘禺愋缘腄NA切割。

泛素蛋白的C末端通常通過(guò)酰胺鍵與靶蛋白的氨基團(tuán)連接在一起，最常見(jiàn)的是與靶蛋白賴(lài)氨酸的ε氨基團(tuán)相連。Recombinant Human FLRT1 Protein,His Tag

確保Cre重組酶只作用于特定細(xì)胞，主要通過(guò)以下幾種方式實(shí)現(xiàn)：1.**組織特異性啟動(dòng)子**：-利用組織特異性啟動(dòng)子控制Cre重組酶的表達(dá)，可以確保Cre酶只在特定組織或細(xì)胞中表達(dá)。這種方法通過(guò)將Cre基因置于特定細(xì)胞類(lèi)型特有的啟動(dòng)子控制之下，實(shí)現(xiàn)對(duì)Cre酶表達(dá)的精確控制。2.**誘導(dǎo)型Cre重組酶系統(tǒng)**：-通過(guò)使用Cre-ERT（雌素受體突變體與Cre重組酶的融合蛋白），可以實(shí)現(xiàn)對(duì)Cre活性的時(shí)間控制。在無(wú)他莫昔芬誘導(dǎo)時(shí)，Cre-ERT與熱激蛋白Hsp90結(jié)合，定位于細(xì)胞質(zhì)中；當(dāng)他莫昔芬給藥誘導(dǎo)時(shí)，Hsp90脫離Cre-ERT，使Cre-ERT進(jìn)入細(xì)胞核發(fā)揮基因重組的作用。這種系統(tǒng)相當(dāng)于為Cre-Lox系統(tǒng)加裝了一個(gè)由他莫昔芬控制的外源開(kāi)關(guān)，使得體內(nèi)基因編輯更具時(shí)空靈活性。3.**藥物誘導(dǎo)的Cre系統(tǒng)**：-例如Tet-on系統(tǒng)，通過(guò)四環(huán)素或其衍生物多西環(huán)素的添加來(lái)激起基因表達(dá)。在三重轉(zhuǎn)基因動(dòng)物中，rtTA在特定啟動(dòng)子的控制下表達(dá)，多西環(huán)素與rtTA結(jié)合，Cre的表達(dá)，導(dǎo)致固定的報(bào)告基因重組。4.**AAV遞送Cre**：-利用包含組織特異性啟動(dòng)子的腺相關(guān)病毒（AAV）載體可以選擇性地將Cre重組酶遞送至特定細(xì)胞。

Recombinant Human FLRT1 Protein,His Tag