DNA探針是**常用的核酸探針,指長度在幾百堿基對(duì)以上的雙鏈DNA或單鏈DNA探針?,F(xiàn)已獲得DNA探針數(shù)量很多,有細(xì)菌、病毒、原蟲、***、動(dòng)物和人類細(xì)胞DNA探針。這類探針多為某一基因的全部或部分序列,或某一非編碼序列。這些DNA片段須是特異的,如細(xì)菌的毒力因子基因探針和人類Alu探針。這些DNA探針的獲得有賴于分子克隆技術(shù)的發(fā)展和應(yīng)用。以細(xì)菌為例,分子雜交技術(shù)用于細(xì)菌的分類和菌種鑒定比之G+C百分比值要準(zhǔn)確的多,是細(xì)菌分類學(xué)的一個(gè)發(fā)展方向。加之分子雜交技術(shù)的高敏感性,分子雜交在臨床微生物診斷上具有廣闊的前景。為此,一般也采用鎢絲熱發(fā)射電子槍和2-3個(gè)聚光鏡的結(jié)構(gòu)。黃浦區(qū)品牌探針五星服務(wù)
探針的標(biāo)記也可以采用隨機(jī)引物法,即向變性的探針溶液加入6個(gè)核苷酸的隨機(jī)DNA小片段,作為引物,當(dāng)后者與單鏈DNA互補(bǔ)結(jié)合后,按堿基互補(bǔ)原則不斷在其3’OH端添加同位素標(biāo)記的單核苷酸,這樣也可以獲得比放射性很高的DNA探針。DNA探針是以病原微生物DNA或RNA的特異性片段為模板,人工合成的帶有放射性或生物素標(biāo)記的單鏈DNA片段,可用來快速檢測(cè)病原體。DNA探針將一段已知序列的多聚核苷酸用同位素、生物素或熒光染料等標(biāo)記后制成的探針。可與固定在硝酸纖維素膜的DNA或RNA進(jìn)行互補(bǔ)結(jié)合,經(jīng)放射自顯影或其他檢測(cè)手段就可以判定膜上是否有同源的核酸分子存在。奉賢區(qū)挑選探針五星服務(wù)電子探針又稱微區(qū)X射線光譜分析儀、X射線顯微分析儀。
基因探針,即核酸探針,是一段帶有檢測(cè)標(biāo)記,且順序已知的,與目的基因互補(bǔ)的核酸序列(DNA或RNA)?;蛱结樛ㄟ^分子雜交與目的基因結(jié)合,產(chǎn)生雜交信號(hào),能從浩瀚的基因組中把目的基因顯示出來。根據(jù)雜交原理,作為探針的核酸序列至少必須具備以下兩個(gè)條件:①應(yīng)是單鏈,若為雙鏈,必須先行變性處理。②應(yīng)帶有容易被檢測(cè)的標(biāo)記。它可以包括整個(gè)基因,也可以**是基因的一部分;可以是DNA本身,也可以是由之轉(zhuǎn)錄而來的RNA。DNA探針根據(jù)其來源有3種:一種來自基因組中有關(guān)的基因本身,稱為基因組探針(genomic probe);另一種是從相應(yīng)的基因轉(zhuǎn)錄獲得了mRNA,再通過逆轉(zhuǎn)錄得到的探針,稱為cDNA探針(cDNA probe)。與基因組探針不同的是,cDNA探針不含有內(nèi)含子序列。此外,還可在體外人工合成堿基數(shù)不多的與基因序列互補(bǔ)的DNA片段,稱為寡核苷酸探針。
進(jìn)行分子突變需要大量的探針拷貝,后者一般是通過分子克?。╩olecular cloning)獲得的。克隆是指用無性繁殖方法獲得同一個(gè)體、細(xì)胞或分子的大量復(fù)制品。當(dāng)制備基因組DNA探針前,應(yīng)先制備基因組文庫,即把基因組DNA打斷,或用限制性酶作不完全水解,得到許多大小不等的隨機(jī)片段,將這些片段體外重組到運(yùn)載體(噬菌體、質(zhì)粒等)中去,再將后者轉(zhuǎn)染適當(dāng)?shù)乃拗骷?xì)胞如大腸肝菌,這時(shí)在固體培養(yǎng)基上可以得到許多攜帶有不同DNA片段的克隆噬菌斑,通過原位雜交,從中可篩出含有目的基因片段的克隆,然后通過細(xì)胞擴(kuò)增,制備出大量的探針。電子束轟擊樣品表面將產(chǎn)生特征X射線,不同的元素有不同的X射線特征波長和能量。
特異性探針有三種形式——cDNA、RNA、寡核苷酸。cDNA和寡核苷酸是**常采用的探針。RNA探針用途很廣,也容易獲得,但其不穩(wěn)定性限制了其商業(yè)用途。cDNA探針的獲得是,將特定的基因片段裝載到質(zhì)?;蚴删w中,經(jīng)過擴(kuò)增、酶切、純化等復(fù)雜的步驟,才能得到一定長度的cDNA探針。這一過程比較復(fù)雜,有相應(yīng)條件的實(shí)驗(yàn)室才能做到。寡核苷酸探針是在已知基因序列的情況下,由核酸合成儀來完成,可廉價(jià)獲得大量的此類探針。質(zhì)量也相對(duì)來說更為穩(wěn)定。由于cDNA探針長度通常為數(shù)百至數(shù)千個(gè)堿基,所以有良好的信號(hào)放大作用,但其滲透性比較差。寡核苷酸探針一般為十?dāng)?shù)個(gè)至數(shù)十個(gè)堿基,滲透性強(qiáng),但信號(hào)放大作用則較差,合成的多相寡核苷酸探針,敏感性可以達(dá)到cDNA探針?biāo)?。還能全自動(dòng)進(jìn)行批量(預(yù)置9999測(cè)試點(diǎn))定量分析。黃浦區(qū)品牌探針五星服務(wù)
計(jì)算時(shí)應(yīng)用布拉格方程:nλ=2dsinθ。黃浦區(qū)品牌探針五星服務(wù)
為了制備cDNA 探針,首先需分離純化相應(yīng)mRNA,這從含有大量mRNA的組織、細(xì)胞中比較容易做到,如從造血細(xì)胞中制備α或β珠蛋白mRNA。有了mRNA作模板后,在逆轉(zhuǎn)錄酶的作用下,就可以合成與之互補(bǔ)的DNA(即cDNA),cDNA與待測(cè)基因的編碼區(qū)有完全相同的堿基順序,但內(nèi)含子已在加工過程中切除。寡核苷酸探針是人工合成的,與已知基因DNA互補(bǔ)的,長度可從十幾到幾十個(gè)核苷酸的片段。如*知蛋白質(zhì)的氨基酸順序量,也可以按氨基酸的密碼推導(dǎo)出核苷酸序列,并用化學(xué)方法合成。黃浦區(qū)品牌探針五星服務(wù)
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