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天津免疫沉淀檢測CoIP-mass spectrometry

來源: 發(fā)布時(shí)間:2024-10-16

免疫共沉淀CoIP實(shí)驗(yàn),細(xì)胞的收集及裂解方法如下:

收集2E7個(gè)細(xì)胞樣品,加入PBS洗滌細(xì)胞,離心后棄上清收集細(xì)胞沉淀。

準(zhǔn)備500μl預(yù)冷的CellLysisBuffer,分別加入5μlProteaseInhibitor、5μlPMSF,混勻后加進(jìn)細(xì)胞沉淀中吹打均勻,冰上孵育30min,期間渦旋混勻幾次。

4℃,12000rpm離心10min,取上清,進(jìn)行蛋白濃度測定及后續(xù)實(shí)驗(yàn)。廣州基云生物,在IP互作組檢測和關(guān)鍵機(jī)制分子篩選驗(yàn)證領(lǐng)域,具有豐富的經(jīng)驗(yàn),助力您的互作機(jī)制研究,歡迎垂詢合作。 Co-IP技術(shù)廣泛應(yīng)用于生物醫(yī)學(xué)、藥物研發(fā)、蛋白質(zhì)組學(xué)等領(lǐng)域,助力科研人員探索生命奧秘!天津免疫沉淀檢測CoIP-mass spectrometry

結(jié)合了抗體的磁珠或樹脂(Beads)與樣本裂解液孵育,通過”抗原-抗體“之間的免疫作用,誘餌蛋白被吸附在Beads上,與此同時(shí),誘餌蛋白的互作蛋白,也一起“共沉淀”到Beads上。洗滌去掉未結(jié)合的蛋白后,再用洗脫緩沖液將互作蛋白復(fù)合物從Beads上洗脫下來,得到免疫共沉淀(Co-IP)產(chǎn)物。Co-IP產(chǎn)物既可以用WesternBlot檢測已知蛋白,也可以用質(zhì)譜鑒定未知蛋白。當(dāng)沒有合適的誘餌蛋白抗體時(shí),還可以通過表達(dá)融合了Flag標(biāo)簽的誘餌蛋白,利用Flag標(biāo)簽抗體做免疫沉淀。即樣本過表達(dá)Flag-Bait,經(jīng)裂解后與anti-Flag珠子孵育,誘餌融合蛋白與Beads結(jié)合,其互作蛋白“共沉淀”到Beads上,再經(jīng)洗滌、洗脫后,用WB或質(zhì)譜檢測。中國香港互作機(jī)制CoIP mass spectrometry檢測免疫共沉淀法證實(shí)蛋白互作,基于抗體專一性,揭示生理性相互作用。

對(duì)于Co-IP實(shí)驗(yàn)初學(xué)者,常遇到的“坑”主要有:首先,抗體選擇至關(guān)重要。選擇特異性不強(qiáng)或親和力低的抗體,可能導(dǎo)致非特異性結(jié)合,干擾實(shí)驗(yàn)結(jié)果。因此,選擇經(jīng)過驗(yàn)證的高質(zhì)量抗體是關(guān)鍵。其次,實(shí)驗(yàn)操作規(guī)范不容忽視。細(xì)胞裂解不充分、洗滌不當(dāng)?shù)榷紩?huì)影響蛋白復(fù)合物的純化,進(jìn)而影響實(shí)驗(yàn)結(jié)果。初學(xué)者應(yīng)嚴(yán)格按照步驟操作,確保每一步都精確無誤。再者,結(jié)果解讀需謹(jǐn)慎。初學(xué)者可能因經(jīng)驗(yàn)不足,誤將非特異性結(jié)合視為真實(shí)相互作用。因此,解讀結(jié)果時(shí),需結(jié)合其他實(shí)驗(yàn)方法如Western Blot進(jìn)行驗(yàn)證。另外,實(shí)驗(yàn)安全不可忽視。遵守實(shí)驗(yàn)室規(guī)章制度,注意個(gè)人防護(hù)和實(shí)驗(yàn)室衛(wèi)生,是確保實(shí)驗(yàn)順利進(jìn)行的基礎(chǔ)。綜上所述,初學(xué)者在進(jìn)行Co-IP實(shí)驗(yàn)時(shí),應(yīng)關(guān)注抗體選擇、實(shí)驗(yàn)操作、結(jié)果解讀和實(shí)驗(yàn)安全等方面,通過不斷學(xué)習(xí)和實(shí)踐,逐漸積累經(jīng)驗(yàn),避免常見錯(cuò)誤。

免疫共沉淀(Co-Immunoprecipitation)是一種基于抗原與抗體特異性結(jié)合用于研究蛋白質(zhì)與蛋白質(zhì)相互作用的方法。常用于候選目標(biāo)蛋白質(zhì)之間是否有相互作用,也用于確定與已知蛋白質(zhì)互作的其它未知蛋白質(zhì)相互作用?;驹恚寒?dāng)細(xì)胞在非變性條件下被裂解時(shí),完整細(xì)胞內(nèi)存在的許多蛋白質(zhì)-蛋白質(zhì)間的相互作用被保留了下來。用蛋白質(zhì)A的抗體免疫沉淀A,那么與A互作的蛋白質(zhì)也能沉淀下來,此時(shí)獲得與A互作的蛋白復(fù)合物。若已知AB互作,則用蛋白復(fù)合物進(jìn)行WB實(shí)驗(yàn)檢測B;若鑒定蛋白復(fù)合物中有哪些蛋白,則對(duì)復(fù)合物進(jìn)行質(zhì)譜檢測。免疫共沉淀實(shí)驗(yàn)流程:蛋白質(zhì)樣本收集-A抗體沉淀目的蛋白A-SDS-PAGE分離-WB檢測B蛋白或者質(zhì)譜鑒定互作蛋白。免疫共沉淀法可信度高,可發(fā)現(xiàn)新蛋白搭檔,但存局限,需結(jié)合其他方法驗(yàn)證。

Co-IP(免疫共沉淀)技術(shù)是一種用于研究蛋白質(zhì)相互作用的重要方法。它利用特異性抗體與目標(biāo)蛋白結(jié)合,形成免疫復(fù)合物,并通過沉淀步驟將復(fù)合物從細(xì)胞或組織提取物中分離出來。這種技術(shù)能夠直接檢測蛋白質(zhì)之間的相互作用,為揭示蛋白質(zhì)功能和調(diào)控機(jī)制提供了有力工具。在實(shí)際應(yīng)用中,研究人員需要選擇合適的抗體,確保其與目標(biāo)蛋白具有特異性結(jié)合能力。此外,樣品的制備、洗滌和離心等步驟也至關(guān)重要,以確保結(jié)果的準(zhǔn)確性和可靠性。Co-IP技術(shù)已廣泛應(yīng)用于生物學(xué)和醫(yī)學(xué)研究領(lǐng)域,如信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)、疾病機(jī)制等。然而,該技術(shù)也存在一些潛在的限制和影響因素,如非特異性結(jié)合和背景噪聲等,因此在使用時(shí)需要注意相應(yīng)的實(shí)驗(yàn)條件和操作細(xì)節(jié)。總之,Co-IP技術(shù)是一種重要的蛋白質(zhì)相互作用研究工具,其結(jié)果可靠且有助于深入了解蛋白質(zhì)功能和調(diào)控機(jī)制。CoIP實(shí)驗(yàn)技術(shù)重復(fù)和生物重復(fù)設(shè)計(jì)建議。重慶免疫共沉淀檢測CoIP聯(lián)合質(zhì)譜檢測

IP-WB實(shí)驗(yàn)常用于驗(yàn)證蛋白質(zhì)之間的相互作用。天津免疫沉淀檢測CoIP-mass spectrometry

IP-Mass(免疫沉淀-質(zhì)譜)實(shí)驗(yàn)流程主要包括以下步驟:樣品制備:收集細(xì)胞或組織樣品,并進(jìn)行適當(dāng)?shù)牧呀馓幚?,以釋放?xì)胞內(nèi)的蛋白質(zhì)。免疫沉淀:將特異性抗體與目標(biāo)蛋白結(jié)合,形成抗原-抗體復(fù)合物。隨后,將復(fù)合物與固相載體(如磁珠)結(jié)合,通過洗滌步驟去除非特異性結(jié)合的雜質(zhì)。洗脫:從固相載體上洗脫免疫沉淀得到的蛋白質(zhì)復(fù)合物,以便進(jìn)行后續(xù)的質(zhì)譜分析。蛋白酶消化:將洗脫下來的蛋白質(zhì)復(fù)合物進(jìn)行蛋白酶消化,將其分解成小分子的肽段。質(zhì)譜分析:將消化后的肽段進(jìn)行質(zhì)譜分析,通過測量肽段的質(zhì)量和電荷信息,鑒定出蛋白質(zhì)的種類和序列。數(shù)據(jù)分析:對(duì)質(zhì)譜數(shù)據(jù)進(jìn)行處理和分析,確定與目標(biāo)蛋白相互作用的蛋白質(zhì),以及相互作用的可能性和強(qiáng)度。IP-Mass實(shí)驗(yàn)流程結(jié)合了免疫沉淀的高特異性與質(zhì)譜分析的高靈敏度,能夠準(zhǔn)確地鑒定蛋白質(zhì)相互作用,并為后續(xù)的功能研究和藥物開發(fā)提供有力支持。天津免疫沉淀檢測CoIP-mass spectrometry

標(biāo)簽: 蛋白組芯片 RIP CoIP ChIP
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