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2021 年 1 月，山東大學齊魯醫(yī)院泌尿外科李巖老師發(fā)表了小鼠膀胱尿路上皮細胞圖譜和上皮亞群分化特征的相關成果，文章的 10x Genomics 單細胞轉錄組測序實驗和分析工作由歐易生物提供。該研究對小鼠的膀胱上皮進行了高通量單細胞轉錄組測序，繪制了小鼠膀胱...

h5Seurat 文件格式是專門為存儲和分析多模態(tài)單細胞和空間表達數(shù)據(jù)而設計的，比如 CITE-seq 或 10X Visium 技術。它能夠保存所有分子信息和相關描述的數(shù)據(jù)，包括降維信息、空間坐標以及細胞群標簽等。HDF 是用于存儲和分發(fā)科學數(shù)據(jù)的一種自我...

單細胞RNA-seq能夠**地提供每個細胞的RNA表達譜，并鑒定異質細胞群中的稀有細胞。盡管**異質性可歸因于累積突變，但即使是遺傳上相同的細胞在相同環(huán)境下也可能表現(xiàn)出基因和蛋白表達水平的差異，從而導致耐藥性的產(chǎn)生。單細胞RNA-seq就能夠發(fā)現(xiàn)這些稀有個體。...

綜上所述，本研究應用RNA-seq轉錄組分析結合iTRAQ蛋白質組學技術，探討油茶種子不同成熟期儲量積累的動態(tài)變化。此外，作者還探討了黃酮類化合物和脂肪酸的生物合成和代謝可能的調控機制。許多功能轉錄本(16530)和蛋白質物種(1228)的模式發(fā)生了***變化...

通過蛋白質組學+轉錄組學研究方法，發(fā)現(xiàn)大黃素引發(fā)外泌體通過抑制代謝通路來減少肺泡巨噬細胞的活化和改善肺部炎癥的特征，探究了外泌體在參與炎癥相關***損傷中的重要作用，為大黃素可以通過減少胰腺外泌體介導的肺泡巨噬細胞活化來減輕嚴重急性胰腺炎相關的急性肺損傷提供依...

LC-MS+GC-MS雙平臺代謝組學研究案例，中文標題：使用無偏差代謝組學方法鑒定短期暴露于顆粒物和微生物氣溶膠中的青年人尿液生物標志物研究對象：年輕健康志愿者發(fā)表期刊：EnvironmentalPollution影響因子：8.071發(fā)表時間：2022年4月1...

糞便LC-MS代謝組學研究方法，2022年，復旦大學上海市第五人民醫(yī)院創(chuàng)傷急危重癥醫(yī)學科唐建國教授課題組在FrontiersinCellularandInfectionMicrobiology期刊發(fā)表的題為“DiallylDisulfide(DADS)Amel...

文章使用TMT標記定量蛋白質組學的方法，分析鑒定了差異表達的蛋白質，對下調的蛋白質進行基因本體論(GO)分析，顯示下調參與線粒體電子傳遞鏈（ETC）的途徑富集，證明了TM處理特別影響了具有較高細胞內銅水平的SOX2/OCT4+細胞中的線粒體ETC途徑。確定TM...

隨著美國臨床蛋白質組**分析項目（CPTAC）和中國人類蛋白質組計劃(CNHPP)等大型蛋白質組學研究計劃的推進，發(fā)表了一系列**的大規(guī)模人群多組學分析文章[2,3]。這些高分文章通過基因組學、轉錄組學、蛋白質組學、磷酸化蛋白質組學、代謝組學、微生物組學等技術...

非靶向代謝組學研究：通過在三個成熟階段收獲兩個東方甜瓜品種的果實作者使用非靶代謝組學聯(lián)合轉錄組學發(fā)現(xiàn)可溶性糖和有機酸在轉錄組水平和代謝組水平的差異現(xiàn)象。這項研究運用多組學技術聯(lián)合揭示了兩個品種成熟過程中關鍵的代謝和轉錄特征。在本研究中，通過代謝和轉錄組分析的綜...

轉錄組學和蛋白質組學分析作者通過轉錄組學和蛋白質組學分析暴露于DON的C2C12細胞的差異基因（DEG）。轉錄組學鑒定了2387個DEG，其中72%被下調。蛋白質組學鑒定出402個DEG，其中74%被下調。GO和KEGG通路富集分析表明，轉錄組學DEGs參與了...

GC-MS非靶向代謝組學yan'j2021年11月，上海交通大學醫(yī)學院附屬新華醫(yī)院馮麗萍教授課題組在Science of the Total Environment期刊發(fā)表了題為“Transcriptomics integrated with metabo...

為了確定TMT AD蛋白網(wǎng)絡模塊是否也存在于其他的隊列和大腦區(qū)域，使用 TMT標記定量蛋白質組學多個隊列的所有組織，為每個隊列生成蛋白質共表達網(wǎng)絡，并評估了 AD 網(wǎng)絡模塊是否保留在每個隊列和大腦區(qū)域中。發(fā)現(xiàn)幾乎所有的 TMT AD 網(wǎng)絡模塊都保留在隊列和大腦...

GC-MS代謝組學結果：通過GC-MS代謝組學觀察到 92種化合物，其中，49種與數(shù)據(jù)庫中可用的化合物相匹配，包括重要的發(fā)酵代謝物，如葡萄糖、**酸、琥珀酸和幾種 (n=10) 初級氨基酸。NMR也觀察到了七種已鑒定的化合物。通過 GC-MS 測量，表面（15...

采用TMT標記定量蛋白質組學技術對三個脫水特殊階段（21、27和40DAP）的新鮮蓮種胎進行了蛋白質組學分析，共鑒定了5,477個蛋白質。對測試樣本進行了PCA分析，結果顯示，不同組間樣品具有很好的區(qū)分，每組的三個重復樣本被聚集在一起。PCA的前兩個成分占總方...

本研究應用空間代謝組學能夠客觀地識別食管腺*。EA組磷脂富含長鏈、多不飽和的PGs。并且，遺傳學研究表明，這一機制與脂肪酸從頭合成有關。這些結果表明，空間代謝組學可以區(qū)分惡性食管中的組織類型。在臨床應用包括客觀診斷和術中切緣評估具有潛在價值。在獲得AFAD...

本研究通過酵母雙雜交篩選，鑒定到 CRY1 可以與 SWR1 復合物關鍵亞基 SWC6、ARP6 結合，共同以藍光依賴模式調控 H2A.Z 在染色質的沉積。藍光***的 CRY1 可以增強 SWC6 與 ARP6 的相互作用。此外，HY5 也可以與 SWC6、...

蛋白質組數(shù)據(jù)分析鑒定出了幾種參與肝葡萄糖脂代謝的蛋白質（ACC、FASN、SCD1、CPT1A、GLUT2、GK、GS、G6Pase、PEPCK）。此外，AC顯示出抑制脂肪生成酶（ACC，F(xiàn)ASN和SCD1）表達的趨勢，同時***上調了GLUT2。與對照組相比...

蛋白質組學(由鹿明生物提供技術支持)；2021年8月，中國醫(yī)學科學院基礎醫(yī)學研究所趙春華和韓欽課題組在Aging and disease期刊發(fā)表了題為“MSC-derived Exosomes can Enhance the Angiogenesis of H...

雙平臺代謝組學研究，2022年02月，中國中醫(yī)科學院廣安門醫(yī)院李敏教授課題組在Biomedicine & Pharmacotherapy發(fā)表的題為 “Yiqi Tongluo Fang could preventive and delayed developm...

糞便代謝組分析，中文標題：二烯丙基二硫化物(DADS)通過調節(jié)腸道微生物群和代謝物來保護小鼠腸道及改善白色念珠菌***研究對象：小鼠糞便發(fā)表期刊：FrontiersinCellularandInfectionMicrobiology影響因子：5.293發(fā)表時間...

研究表明，MYC對磷脂酰肌醇（PI）代謝具有組織特異性。作者通過空間代謝組學檢測到RCC和T-ALL中，MYC可逆地降低了PI；但在LC和HCC中，MYC反而增加了這些物質（圖 7）。可能是由于肺表面富含PG和PI，MYC才會增加了LC中的PI含量。作者推斷，...

作者通過泛素化蛋白組學分析鑒定了茶樹作根中的泛素化蛋白質。中文標題：氮調節(jié)茶樹根中茶氨酸和黃酮類化合物的生物合成：多組學分析揭示的蛋白質水平調節(jié)研究對象：茶樹根發(fā)表期刊：JournalofAgriculturalandFoodChemistry影響因子：5.2...

高通量代謝組學研究,中文標題：高通量代謝組學方法發(fā)現(xiàn)***羊藿提取物對骨質疏松癥影響的代謝生物標志物及途徑發(fā)表期刊：Frontiersinpharmacology影響因子：5.810發(fā)表時間：2020年8月發(fā)表單位：南昌大學***附屬醫(yī)院運用組學技術：超高效液...

蛋白質是生命功能的直接體現(xiàn)者，近幾年來，蛋白質組研究越來越多的體現(xiàn)在多種疾病機理的闡明，為科研問題攻克提供理論根據(jù)和解決途徑。通過蛋白質組比較分析，找到特異性的蛋白，成為新藥物設計的分子靶點，為疾病的早期診斷提供分子標志。然而生物體內的蛋白組學是一個非常復雜的...

GC-MS非靶向代謝組：隨著納米材料的產(chǎn)業(yè)化,各種形式的納米材料將以不同途徑進入人們的生活,納米材料的生物安全性問題正受到世界各國科學家的***關注，本篇為2020年2月，南京大學環(huán)境學院課題組在Environmental Science & Technolo...

空間代謝組學：質譜成像方法提供了一種直接獲取代謝網(wǎng)絡信息的途徑，以系統(tǒng)地深入了解大腦的代謝活動?；贙EGG數(shù)據(jù)庫的Metaboanalyst軟件進行代謝網(wǎng)絡分析。共找到20條KEGG代謝通路，包含126個具有微區(qū)信息的代謝物，圖2顯示了涉及丙氨酸-天冬氨酸和...

代謝組學研究：濃香白酒占中國白酒總產(chǎn)量的70%以上。自1960年代以來，在中國白酒釀造行業(yè)中，人工窖泥被***用于建造發(fā)酵窖以生產(chǎn)高質量的濃香白酒。為了深入了解人工窖泥原核生物分類和功能動力學機制，以及這種變化與生產(chǎn)高質量濃香白酒之間的聯(lián)系，本文對該釀造微生態(tài)...

使用TMT標記定量蛋白質組學分析，與GFP-群體相比，在GFP+細胞中TM處理后，線粒體復合物IV的多個亞基被特異性下調，對下調的蛋白質進行基因本體 (GO)分析，顯示參與線粒體電子傳遞鏈 (ETC) 的通路富集。同時作者還分析了從人 LM2 細胞系中分選的 ...

iTRAQ標記蛋白組學研究方法：2021年12月歐易/鹿明生物合作客戶甘肅農(nóng)業(yè)大學孫萬倉教授課題組在Scientific Reports期刊發(fā)表的題為 “iTRAQ-Based Quantitative Proteome Analysis Insights i...