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廣東微滴式數(shù)字PCR性能特點

來源: 發(fā)布時間:2023-01-15

dPCR的測量結(jié)果通常表示為含量,即拷貝數(shù)值或轉(zhuǎn)基因質(zhì)量百分比,而QPCR結(jié)果通常表示為拷貝數(shù)的質(zhì)量分?jǐn)?shù)。目前市場上可購買到大多數(shù)轉(zhuǎn)基因標(biāo)準(zhǔn)物質(zhì),以qPCR定值的標(biāo)準(zhǔn)物質(zhì)是以拷貝數(shù)(單倍體基因組當(dāng)量)的質(zhì)量分?jǐn)?shù)來表示特性量;以dPCR定值的標(biāo)準(zhǔn)物質(zhì)直接采用拷貝數(shù)比例來表示特性量。不同方法使用不同的表示方式,會造成測量結(jié)果不可比。因此質(zhì)量分?jǐn)?shù)、拷貝數(shù)和拷貝數(shù)比例之間的關(guān)系需要轉(zhuǎn)化,才能得到單位一致,數(shù)值可比的數(shù)據(jù)。EU聯(lián)合研究中心建議使用轉(zhuǎn)換因子從拷貝數(shù)換算到質(zhì)量分?jǐn)?shù)。數(shù)字PCR即Digital PCR(dPCR),它是一種核酸分子定量技術(shù)。廣東微滴式數(shù)字PCR性能特點

數(shù)字PCR技術(shù)的出現(xiàn)不是為了完全取代原有分子診斷技術(shù),而是更好的補充和完善現(xiàn)有技術(shù)平臺。數(shù)字PCR為不同應(yīng)用場景下的多樣化核酸檢測需求提供了新的思路,尤其是在臨床檢測方面,在 性疾病早期檢測、 疾病的伴隨診斷、生殖遺傳篩查等領(lǐng)域展現(xiàn)出良好的應(yīng)用前景。國產(chǎn)數(shù)字PCR企業(yè)在商業(yè)化應(yīng)用方面,也不斷“攻城略地”。新羿生物在檢測及 疾病伴隨診斷方面開發(fā)了一系列試劑盒,并積極推進(jìn)注冊臨床試驗;領(lǐng)航基因聚焦在血流 (膿毒癥)及呼吸道 領(lǐng)域,相繼推出了多款病原菌檢測試劑盒;銳訊生物聚焦于檢測,2020年其產(chǎn)品獲得FDA緊急授權(quán)。除此之外,在公共衛(wèi)生領(lǐng)域,國產(chǎn)數(shù)字PCR企業(yè)針對食源性致病菌、鼠疫、蟲媒病毒等,也推出多種檢測試劑盒。賽默飛數(shù)字PCR價格數(shù)字PCR適用于依靠Ct值不能很好分辨的應(yīng)用領(lǐng)域。

PCR常使用目標(biāo)序列的拷貝數(shù)或某一給定樣品中轉(zhuǎn)基因的百分比來體現(xiàn)方法靈敏度。由于qPCR和dPCR實驗過程所用試劑的兼容性較好,在使用dPCR進(jìn)行轉(zhuǎn)基因檢測時,通常直接參照qPCR的方法。使用不同技術(shù)對相同樣品檢測時,兩種方法的靈敏度是否具有可比性成為關(guān)注的問題。Burns等21]使用Fluidigm公司的12.765(12板,每板765個微單元)芯片數(shù)字PCR分析儀測定標(biāo)準(zhǔn)物質(zhì)ERM-AD413檢測轉(zhuǎn)基因玉米MON810。該小組應(yīng)用dPCR技術(shù)評估在qPCR定義下的靈敏度數(shù)值,在拷貝數(shù)200-700之間,dPCR與qPCR的測量結(jié)果具有一致性。但與qPCR的靈敏度相比,dPCR在低于拷貝數(shù)200時有被低估的風(fēng)險,在高于拷貝數(shù)1000時有被高估的風(fēng)險。dPCR在同一陣列上同時測量轉(zhuǎn)基因和內(nèi)源性靶點時,需要稀釋內(nèi)源性靶點和轉(zhuǎn)基因靶點在合理拷貝數(shù)范圍內(nèi)以保證dPCR測量結(jié)果的準(zhǔn)確性。

在熒光定量PCR應(yīng)用已經(jīng)如此的情況下,緣何數(shù)字PCR仍然能橫空出世?中心點在于熒光定量PCR盡管為科研和臨床市場應(yīng)用提供了非常重要的檢測工具支撐,但仍然有尚未被滿足的客戶需求。熒光定量PCR需要基于標(biāo)準(zhǔn)品制作的標(biāo)準(zhǔn)曲線進(jìn)行定量,屬于相對定量,操作較為復(fù)雜,且終端用戶對其結(jié)果的重復(fù)性、靈敏性、精密度、分辨率、對PCR反應(yīng)抑制劑的耐受性等方面有更高的期待。數(shù)字PCR通過將反應(yīng)體系進(jìn)行有限稀釋至成千上萬的反應(yīng)單元中,實現(xiàn)了核酸靶標(biāo)的單分子擴增。PCR擴增結(jié)束后,基于終點法對陽性液滴數(shù)和總液滴數(shù)進(jìn)行計數(shù),結(jié)合泊松分布原理,從而實現(xiàn)對起始樣本的定量。其極大地簡化了操作步驟,并且大幅提高了檢測性能,尤其在低豐度或較低豐度的核酸檢測上(靈敏性可達(dá)0.001-0.0001%),其優(yōu)異的性能得到了終端用戶的認(rèn)可。通過“儀器+試劑”相互配合的方式,打出了數(shù)字PCR檢測的“組合拳”。

ThermoFisherQuantStudio3D是另一個經(jīng)典的芯片式數(shù)字PCR平臺,其基本的檢測流程是:將反應(yīng)液加入到涂布器中,通過涂布器將反應(yīng)液均勻涂布在有20000個微孔的芯片上,將芯片放在PCR儀上擴增,將芯片放入讀取儀中采取拍照的方式讀取熒光信號。操作較為復(fù)雜,整個過程在封閉的芯片中進(jìn)行,污染的風(fēng)險較低。STILLANaica是一個較新的數(shù)字PCR平臺,基本的檢測流程是:將反應(yīng)液加入芯片,將芯片放入微滴生成擴增系統(tǒng),生成30,000個微滴單層平鋪于芯片中,PCR擴增在芯片上完成。然后將擴增后的芯片轉(zhuǎn)移至微滴閱讀分析系統(tǒng),采取拍照的方式讀取熒光信號。由于整個過程在封閉的芯片中進(jìn)行,污染的風(fēng)險較低。數(shù)字PCR技術(shù)min檢測下限可到2copies/ml,比qPCR靈敏度提升了100倍。銳訊數(shù)字PCR分析應(yīng)用

數(shù)字PCR應(yīng)用前景廣闊,可用于病原微生物檢測、基因檢測、無創(chuàng)產(chǎn)前篩查、測序結(jié)果驗證等領(lǐng)域。廣東微滴式數(shù)字PCR性能特點

了解泊松分布,我們先要從二項式分布說起,二項式分布是一個離散概率分布,它給出了m次試驗中k次成功的可能性,每次試驗的概率為p,例如當(dāng)擲骰子時,二項分布給出了在10次試驗中恰好有7次擲出4的概率。在數(shù)字PCR的情況中,投擲骰子類似于將一個目標(biāo)實體隨機“投擲”到一組分區(qū)中,當(dāng)目標(biāo)落在選定的分區(qū)中時,就是成功。如果有n個分區(qū),并且分區(qū)過程是完全隨機的,則目標(biāo)出現(xiàn)在所選分區(qū)中的概率為1/n。該試驗重復(fù)m次,樣品中的每個分子一次。如下所示的二項式分布給出了k個成功的概率,即所選分區(qū)恰好包含k個分子的概率。數(shù)字PCR通常采用大量分區(qū)。當(dāng)n很大,并且嘗試成功的概率(1/n)很小時,二項分布可以近似為泊松分布。廣東微滴式數(shù)字PCR性能特點

廣州雙螺旋科學(xué)儀器有限公司是一家集研發(fā)、制造、銷售為一體的****,公司位于廣州市黃埔區(qū)銳豐三街4號617房,成立于2015-04-17。公司秉承著技術(shù)研發(fā)、客戶優(yōu)先的原則,為國內(nèi){主營產(chǎn)品或行業(yè)}的產(chǎn)品發(fā)展添磚加瓦。主要經(jīng)營數(shù)字PCR,純水機,病理切片機,倍性分析儀等產(chǎn)品服務(wù),現(xiàn)在公司擁有一支經(jīng)驗豐富的研發(fā)設(shè)計團(tuán)隊,對于產(chǎn)品研發(fā)和生產(chǎn)要求極為嚴(yán)格,完全按照行業(yè)標(biāo)準(zhǔn)研發(fā)和生產(chǎn)。臻準(zhǔn),美國艾科浦,銳訊生物,Sysmex,Eprerdia為用戶提供真誠、貼心的售前、售后服務(wù),產(chǎn)品價格實惠。公司秉承為社會做貢獻(xiàn)、為用戶做服務(wù)的經(jīng)營理念,致力向社會和用戶提供滿意的產(chǎn)品和服務(wù)。數(shù)字PCR,純水機,病理切片機,倍性分析儀產(chǎn)品滿足客戶多方面的使用要求,讓客戶買的放心,用的稱心,產(chǎn)品定位以經(jīng)濟實用為重心,公司真誠期待與您合作,相信有了您的支持我們會以昂揚的姿態(tài)不斷前進(jìn)、進(jìn)步。

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